More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2274 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 216 aa  428  1e-119  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  43.75 
 
 		 226 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  40.2 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  40.84 
 
 		 227 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  40.31 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  39.27 
 
 		 236 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  39.79 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  41.15 
 
 		 218 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  41.15 
 
 		 218 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  40.62 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.74 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  42.55 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  41.4 
 
 		 461 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  38.19 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  39.57 
 
 		 230 aa  131  6e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  43.88 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  41.33 
 
 		 233 aa  128  6e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  39.59 
 
 		 237 aa  128  6e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  42.16 
 
 		 221 aa  128  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 235 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  37.57 
 
 		 234 aa  127  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  40.82 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  35.64 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  44.21 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  35.11 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  36.73 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  41.94 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  39.18 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  37.3 
 
 		 223 aa  124  7e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  41.88 
 
 		 227 aa  124  8.000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  35.86 
 
 		 235 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  36.51 
 
 		 234 aa  124  1e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  36.73 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  40.1 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  40.96 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.02 
 
 		 222 aa  123  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  39.89 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  39.18 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  34.87 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 		 233 aa  121  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  36.22 
 
 		 227 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  36.22 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  40.82 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  36.82 
 
 		 272 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  35.2 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  36.17 
 
 		 209 aa  119  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  36.04 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  37.63 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  38.66 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  39.58 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  36.08 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  41.49 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 218 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  36.08 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  39.69 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 225 aa  118  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 225 aa  118  9e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  35.91 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  37.76 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  35.64 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 		 209 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  35.65 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  34.88 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  33.19 
 
 		 252 aa  114  7.999999999999999e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  33.84 
 
 		 226 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  33.19 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  33.19 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  33.19 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  34.85 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  38.91 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  33.19 
 
 		 252 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.3 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  36.18 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  36.74 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  33.19 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  33.19 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  33.19 
 
 		 252 aa  113  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  40.11 
 
 		 213 aa  112  3e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  38.62 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  32.76 
 
 		 252 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  37.97 
 
 		 229 aa  112  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  32.46 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  32.63 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  32.63 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  32.63 
 
 		 252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>