More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2233 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 238 aa  477  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  87.71 
 
 		 236 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  65.95 
 
 		 237 aa  303  2.0000000000000002e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  61.93 
 
 		 227 aa  260  2e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  49.78 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  49.34 
 
 		 234 aa  224  6e-58  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  48.71 
 
 		 234 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  48.65 
 
 		 231 aa  221  7e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  47.49 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  49.77 
 
 		 233 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  47.14 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  46.58 
 
 		 230 aa  189  4e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  46.7 
 
 		 233 aa  188  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  44.7 
 
 		 225 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  47.35 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  43.78 
 
 		 225 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  43.27 
 
 		 228 aa  178  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.47 
 
 		 232 aa  178  5.999999999999999e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  42.79 
 
 		 225 aa  178  7e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  46.26 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  41.82 
 
 		 227 aa  172  3.9999999999999995e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  43.78 
 
 		 461 aa  171  5.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  44.24 
 
 		 225 aa  163  3e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  46.36 
 
 		 232 aa  162  3e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  43.44 
 
 		 228 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  42.13 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  40.37 
 
 		 222 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 		 250 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  40.31 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  38.31 
 
 		 226 aa  137  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  40.89 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  40.44 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 235 aa  133  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  40.44 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  37.02 
 
 		 224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  34.53 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 		 227 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  35.59 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  36.97 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  35.43 
 
 		 227 aa  123  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 		 218 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  35.78 
 
 		 226 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  35.62 
 
 		 272 aa  122  4e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 		 272 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  36.04 
 
 		 225 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  35.02 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  35.02 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 231 aa  119  3e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  37.81 
 
 		 243 aa  118  6e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  34.39 
 
 		 225 aa  119  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  36.61 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  38.79 
 
 		 224 aa  118  9e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  33.01 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  33.03 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  35.65 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.03 
 
 		 222 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  32.42 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  34.09 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  34.95 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  35.21 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.85 
 
 		 222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  38.6 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  34.22 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  32.87 
 
 		 272 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  34.03 
 
 		 214 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  40.53 
 
 		 209 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  33.03 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  37.37 
 
 		 213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  32.71 
 
 		 228 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  32.57 
 
 		 266 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  41.58 
 
 		 209 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  32.08 
 
 		 226 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  31.98 
 
 		 227 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  32.63 
 
 		 216 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  32.55 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  32.55 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  32.55 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  33.66 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  40.53 
 
 		 209 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 		 232 aa  106  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  35.26 
 
 		 228 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  32.55 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 232 aa  106  4e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 		 229 aa  106  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>