More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1371 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 222 aa  431  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  54.95 
 
 		 223 aa  213  9.999999999999999e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  53.88 
 
 		 461 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  47.17 
 
 		 228 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  45.58 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  40.37 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.79 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  42.47 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  41.63 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  40.87 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  43.58 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  43.13 
 
 		 225 aa  141  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  44.13 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  48.11 
 
 		 225 aa  139  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  42.66 
 
 		 238 aa  138  7.999999999999999e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  45.75 
 
 		 233 aa  137  8.999999999999999e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  39.63 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  45.75 
 
 		 233 aa  135  4e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  42.47 
 
 		 231 aa  135  5e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  43.84 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  39.09 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  39.62 
 
 		 234 aa  131  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  42.47 
 
 		 230 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  44.08 
 
 		 228 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  39.62 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  40.18 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  39.35 
 
 		 221 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  39.09 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  46.92 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  43.98 
 
 		 222 aa  125  8.000000000000001e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  38.69 
 
 		 218 aa  121  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  45.93 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 		 250 aa  118  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  40.1 
 
 		 250 aa  118  7e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  38.03 
 
 		 217 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  38.03 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  33.97 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  32.42 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 		 226 aa  111  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  39.52 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  35.68 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  33.63 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  42.01 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  40.36 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  34.29 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 		 216 aa  106  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.72 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  39.01 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  37.96 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  35.59 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 		 218 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  35.62 
 
 		 229 aa  105  8e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  31.51 
 
 		 225 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.94 
 
 		 222 aa  104  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 		 266 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  31.8 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.56 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  38.46 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 		 272 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  37.61 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  37.79 
 
 		 272 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 227 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  31.46 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 		 209 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  37.79 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  38.53 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  34.86 
 
 		 233 aa  102  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  30.99 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  33.94 
 
 		 223 aa  101  8e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.65 
 
 		 220 aa  101  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  30.99 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  38.43 
 
 		 224 aa  100  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 		 272 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  35.55 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  35.59 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  40.62 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  31.34 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  28.64 
 
 		 228 aa  99.8  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  39.59 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>