More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0118 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  68.22 
 
 
227 aa  308  5e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  58.22 
 
 
233 aa  261  6e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  57.21 
 
 
230 aa  248  7e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  55.26 
 
 
233 aa  246  2e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  55.25 
 
 
233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  52.4 
 
 
233 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  50.7 
 
 
231 aa  223  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  52.97 
 
 
233 aa  223  3e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  50.96 
 
 
234 aa  222  4e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  50.93 
 
 
225 aa  221  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  52.97 
 
 
233 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 
234 aa  218  8.999999999999998e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  50.92 
 
 
225 aa  216  2e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  48.84 
 
 
225 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  48.37 
 
 
225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  52.83 
 
 
231 aa  212  4.9999999999999996e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  48.25 
 
 
228 aa  207  1e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  49.3 
 
 
237 aa  207  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  49.32 
 
 
228 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  49.04 
 
 
227 aa  193  2e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  43.75 
 
 
236 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  47.47 
 
 
461 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  42.47 
 
 
238 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  46.12 
 
 
238 aa  169  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  45.66 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  42.79 
 
 
222 aa  144  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  41.12 
 
 
224 aa  142  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  39.9 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  39.15 
 
 
229 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  38.68 
 
 
229 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  38.43 
 
 
223 aa  134  9e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 
250 aa  132  5e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  38.57 
 
 
237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  37.74 
 
 
229 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  35.75 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  35.27 
 
 
227 aa  125  6e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  35.24 
 
 
223 aa  125  6e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  39.27 
 
 
226 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  38.64 
 
 
221 aa  123  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  38.66 
 
 
213 aa  121  9e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  34.91 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  39.63 
 
 
224 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  34.91 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  34.84 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  32.88 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  35.65 
 
 
227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 
235 aa  119  3e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 
218 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.08 
 
 
222 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 
257 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  36.06 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 
221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  35.65 
 
 
250 aa  116  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 
217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  30.91 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  36.13 
 
 
214 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  34.25 
 
 
218 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
228 aa  115  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  34.36 
 
 
226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  38.02 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  38.3 
 
 
216 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  34.01 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  36.55 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  36.55 
 
 
229 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 
272 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 
272 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  38.22 
 
 
234 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 
272 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  32.08 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.38 
 
 
222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 
272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  35.98 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  32.89 
 
 
243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  33.01 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  34.8 
 
 
221 aa  108  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  32.42 
 
 
230 aa  108  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  33.5 
 
 
218 aa  106  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
237 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  31.77 
 
 
227 aa  106  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  31.37 
 
 
237 aa  105  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  36.04 
 
 
229 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 
227 aa  105  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  36.13 
 
 
222 aa  105  6e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 
266 aa  105  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.8 
 
 
217 aa  105  7e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  36.92 
 
 
225 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 
225 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  35.79 
 
 
225 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  35.57 
 
 
226 aa  104  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 
227 aa  104  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  36.04 
 
 
232 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  32.39 
 
 
272 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  36.04 
 
 
232 aa  104  1e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  35.79 
 
 
225 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  36.04 
 
 
232 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>