More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2296 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 233 aa  467  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  99.57 
 
 		 233 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  92.27 
 
 		 233 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  67.43 
 
 		 230 aa  288  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  65.16 
 
 		 233 aa  288  7e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  64.73 
 
 		 233 aa  285  4e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  51.57 
 
 		 227 aa  231  7.000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  52.97 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  49.06 
 
 		 233 aa  215  4e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  47.98 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  48.17 
 
 		 227 aa  211  9e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  50.94 
 
 		 231 aa  209  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  52.13 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  51.38 
 
 		 225 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  49.54 
 
 		 228 aa  206  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  47.14 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  47.51 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  47.51 
 
 		 225 aa  205  6e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  46.67 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  47.25 
 
 		 238 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  44.49 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  45.62 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  47 
 
 		 238 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  49.32 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  44.64 
 
 		 227 aa  184  8e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  48.66 
 
 		 232 aa  169  3e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 		 461 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  42.66 
 
 		 223 aa  151  8e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  40.37 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  40.81 
 
 		 250 aa  149  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 		 229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  39.34 
 
 		 237 aa  143  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  43.19 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 		 227 aa  138  7e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  42.06 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 		 226 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  40.82 
 
 		 216 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  38.78 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  37.37 
 
 		 235 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  37.97 
 
 		 227 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 		 229 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35.27 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  37.91 
 
 		 229 aa  126  3e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  36.2 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 		 256 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  35.04 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  36.24 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  37.81 
 
 		 231 aa  121  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  34.07 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  38.34 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  36.79 
 
 		 214 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  35.85 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  40.21 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 228 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.6 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  36.92 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  36.92 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  36.11 
 
 		 272 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  37.78 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  36.87 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.92 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  35.93 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  38.74 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  36.19 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  33.94 
 
 		 272 aa  115  5e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  37.86 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 217 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 226 aa  115  8.999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  37.88 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  37.63 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  34.4 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  36.71 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  34.25 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  35.55 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  35.41 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  37.11 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 		 230 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 		 238 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 		 272 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  32.5 
 
 		 225 aa  112  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  34.08 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  36.23 
 
 		 227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  36.23 
 
 		 227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  36.23 
 
 		 227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 226 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  34.25 
 
 		 218 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>