More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3547 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
238 aa  463  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  47.49 
 
 
238 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  45.62 
 
 
236 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  48.85 
 
 
230 aa  196  3e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  49.08 
 
 
233 aa  191  8e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  49.31 
 
 
233 aa  190  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  47.47 
 
 
233 aa  187  1e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  49.03 
 
 
233 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  47 
 
 
233 aa  186  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  47.22 
 
 
225 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  45.24 
 
 
237 aa  185  6e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  45.16 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  47.22 
 
 
225 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 
461 aa  182  6e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  47.47 
 
 
228 aa  181  8.000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  46.54 
 
 
225 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  42.79 
 
 
227 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  45.45 
 
 
231 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  44.71 
 
 
233 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  43.27 
 
 
234 aa  169  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.12 
 
 
232 aa  169  5e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  43.27 
 
 
234 aa  168  8e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  47.6 
 
 
229 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  39.19 
 
 
227 aa  160  1e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  50.23 
 
 
232 aa  159  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  42.13 
 
 
225 aa  158  9e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  41.43 
 
 
231 aa  157  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  43.98 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  40.45 
 
 
226 aa  148  6e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  41.26 
 
 
250 aa  144  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  42.59 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  42.66 
 
 
222 aa  138  8.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  41.96 
 
 
242 aa  137  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  39.62 
 
 
223 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 
226 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  37.96 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  40.62 
 
 
216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  36.87 
 
 
272 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  40.99 
 
 
228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  37.09 
 
 
272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  39.41 
 
 
226 aa  132  6e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.67 
 
 
222 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  36.87 
 
 
272 aa  131  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  37.37 
 
 
235 aa  131  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  36.62 
 
 
272 aa  131  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  36.87 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  40.29 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  37.32 
 
 
229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 
225 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  38.05 
 
 
229 aa  130  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 
221 aa  128  6e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 
225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  39.13 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 
226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  36.24 
 
 
272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
221 aa  128  1.0000000000000001e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  38.35 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  36.84 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.23 
 
 
222 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 
227 aa  126  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  39.9 
 
 
221 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  38.99 
 
 
242 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  38.99 
 
 
242 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  40.43 
 
 
226 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  38.99 
 
 
242 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  38.99 
 
 
245 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  38.99 
 
 
242 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  35.47 
 
 
252 aa  123  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  38.99 
 
 
242 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  38.99 
 
 
245 aa  123  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  34.58 
 
 
227 aa  123  3e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  40.41 
 
 
224 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  38.12 
 
 
237 aa  123  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 
224 aa  123  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 
241 aa  123  3e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  40.41 
 
 
224 aa  123  3e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  35.04 
 
 
252 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 
222 aa  122  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 
225 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  36.67 
 
 
227 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  35.04 
 
 
252 aa  122  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  36.67 
 
 
227 aa  122  4e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  38.32 
 
 
233 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 
218 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  40.38 
 
 
251 aa  122  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 
235 aa  122  7e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  34.85 
 
 
230 aa  122  7e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 
257 aa  121  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  35 
 
 
266 aa  121  9e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 
227 aa  121  9e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  34.62 
 
 
252 aa  121  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  34.62 
 
 
252 aa  120  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  36.84 
 
 
223 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
216 aa  120  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  39.42 
 
 
251 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  38.78 
 
 
218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  41.23 
 
 
213 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>