More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0945 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 226 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  54.67 
 
 		 215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  53.69 
 
 		 229 aa  228  8e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  51.15 
 
 		 221 aa  218  5e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  53.66 
 
 		 237 aa  218  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  53.74 
 
 		 221 aa  218  7.999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  50.24 
 
 		 218 aa  212  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  54.73 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  49.07 
 
 		 225 aa  206  2e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  50.69 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  52.09 
 
 		 221 aa  205  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  49.53 
 
 		 225 aa  205  5e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  46.73 
 
 		 238 aa  205  6e-52  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  46.73 
 
 		 227 aa  204  6e-52  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  48.84 
 
 		 221 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  52.75 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  52.75 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  52.75 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  52.75 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  52.75 
 
 		 241 aa  202  3e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  52.75 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  52.75 
 
 		 241 aa  202  4e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  51.16 
 
 		 222 aa  201  5e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  52.29 
 
 		 241 aa  201  8e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  50.24 
 
 		 237 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  47.89 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  47.66 
 
 		 222 aa  197  9e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  47 
 
 		 221 aa  194  6e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  44.81 
 
 		 222 aa  194  1e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  47.69 
 
 		 229 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  47.91 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  51.35 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  51.71 
 
 		 237 aa  190  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  52.2 
 
 		 238 aa  188  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  52.76 
 
 		 238 aa  187  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  51.22 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  51.22 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  48.34 
 
 		 228 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  45.24 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  48.34 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  48.34 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  47.57 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  44.86 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  44.13 
 
 		 224 aa  181  7e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  52.68 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  47.09 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  42.52 
 
 		 226 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  42.06 
 
 		 223 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  43.06 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  43.43 
 
 		 221 aa  174  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  49.76 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  42.58 
 
 		 223 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  42.58 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  43.54 
 
 		 223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  46.45 
 
 		 222 aa  171  9e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  44.86 
 
 		 230 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  45.75 
 
 		 228 aa  170  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  47.34 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  42.72 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  43.2 
 
 		 229 aa  169  4e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  48.82 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  48.82 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  48.82 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  48.82 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  41.63 
 
 		 223 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  42.72 
 
 		 224 aa  167  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  48.17 
 
 		 229 aa  165  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  41.63 
 
 		 223 aa  165  5e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  41.15 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  41.15 
 
 		 223 aa  164  9e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  46.12 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  46.86 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  41.15 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  46.86 
 
 		 224 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  45.41 
 
 		 219 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  43.2 
 
 		 250 aa  160  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0576  phosphoglycolate phosphatase  46.92 
 
 		 230 aa  158  5e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  46 
 
 		 239 aa  154  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  42.42 
 
 		 227 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  36.89 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  40.64 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  36.45 
 
 		 219 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  37.33 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  39.9 
 
 		 229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  40.93 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  40.93 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  37.44 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  36.06 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  37.57 
 
 		 225 aa  128  9.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  38.22 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  39.17 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  36.2 
 
 		 227 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  40.43 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  40.1 
 
 		 223 aa  123  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  34.65 
 
 		 235 aa  122  4e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  38.27 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  36.74 
 
 		 253 aa  121  8e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  33.84 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>