More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6944 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 257 aa  503  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  59.91 
 
 		 234 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  47.25 
 
 		 226 aa  165  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  42.52 
 
 		 225 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  42.06 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  42.06 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  45.71 
 
 		 227 aa  158  8e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  49.77 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 		 235 aa  156  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  44.34 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  41.82 
 
 		 227 aa  156  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  43.12 
 
 		 227 aa  155  8e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  42.59 
 
 		 238 aa  154  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  40.99 
 
 		 229 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  41.2 
 
 		 227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  42.13 
 
 		 227 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 		 226 aa  152  4e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  44.13 
 
 		 266 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  41.12 
 
 		 225 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  38.32 
 
 		 235 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  43.19 
 
 		 272 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 		 225 aa  150  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  43.81 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 231 aa  148  7e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  39.17 
 
 		 225 aa  148  8e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  46.73 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 		 226 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  39.17 
 
 		 225 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  43.12 
 
 		 226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 		 227 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  39.17 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  39.46 
 
 		 227 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  41.86 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  43.19 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  40.69 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 		 272 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  41.9 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  42.49 
 
 		 221 aa  143  3e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  40.91 
 
 		 228 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  41.9 
 
 		 272 aa  143  3e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  44.95 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  46.19 
 
 		 223 aa  142  6e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  38.91 
 
 		 225 aa  142  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  40.93 
 
 		 227 aa  141  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  42.47 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  44.61 
 
 		 272 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  41.71 
 
 		 225 aa  140  3e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  41.94 
 
 		 272 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  44.62 
 
 		 216 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 		 227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  37.85 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  39.35 
 
 		 230 aa  139  6e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.23 
 
 		 222 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  37.22 
 
 		 226 aa  138  7e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  39.04 
 
 		 242 aa  138  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  42.01 
 
 		 272 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 		 225 aa  137  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  39.01 
 
 		 250 aa  138  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.88 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  45.93 
 
 		 222 aa  137  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  38.86 
 
 		 241 aa  137  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  36.61 
 
 		 230 aa  137  2e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  38.86 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  39.13 
 
 		 227 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 		 261 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 		 232 aa  136  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 		 461 aa  135  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  39.71 
 
 		 231 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  37.32 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  39.34 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  39.27 
 
 		 209 aa  135  5e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  39.04 
 
 		 218 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  35.32 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  42.2 
 
 		 229 aa  134  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  39.23 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  39.23 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  39.23 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  39.23 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  39.23 
 
 		 242 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  38.03 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  39.23 
 
 		 245 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  39.62 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  39.23 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  36.04 
 
 		 232 aa  132  6.999999999999999e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.14 
 
 		 232 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 		 227 aa  132  7.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  38.21 
 
 		 228 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  38.03 
 
 		 238 aa  130  1.0000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  39.55 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  40.87 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  38.03 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>