More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2015 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  100 
 
 		 237 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  87.28 
 
 		 229 aa  397  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  86.4 
 
 		 229 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  65.9 
 
 		 224 aa  261  6e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  66.82 
 
 		 224 aa  248  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  53.85 
 
 		 225 aa  235  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  55.66 
 
 		 221 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  43.04 
 
 		 230 aa  155  7e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  40.37 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  43.58 
 
 		 461 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  39.45 
 
 		 231 aa  149  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  40.76 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  42.22 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  38.39 
 
 		 234 aa  138  7.999999999999999e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  37.91 
 
 		 234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  39.34 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  40.44 
 
 		 238 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  39.34 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 		 233 aa  131  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.57 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  39.46 
 
 		 225 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  40.64 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  39.01 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  38.99 
 
 		 233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  39.01 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 227 aa  126  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  39.63 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  36.45 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  36.45 
 
 		 227 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  33.77 
 
 		 250 aa  123  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  38.12 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.84 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  37.73 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  34.56 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  37.26 
 
 		 227 aa  115  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  36.24 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  40.72 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  33.63 
 
 		 272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  37.84 
 
 		 218 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  37.39 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  30.22 
 
 		 225 aa  108  9.000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  36.62 
 
 		 250 aa  107  1e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  36.45 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 272 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  34.35 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 		 223 aa  105  4e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 		 272 aa  105  7e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  35.5 
 
 		 221 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  37.79 
 
 		 232 aa  104  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  35.78 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  31.8 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 		 222 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  29.22 
 
 		 235 aa  102  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 		 230 aa  102  7e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  29.68 
 
 		 272 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  31.44 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  30.04 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  36.2 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  37.27 
 
 		 218 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  27.19 
 
 		 232 aa  100  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  36.99 
 
 		 227 aa  99.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 		 213 aa  99  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  33.67 
 
 		 214 aa  98.2  9e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  28.11 
 
 		 226 aa  98.2  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  37.27 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  28.18 
 
 		 235 aa  97.1  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  32.89 
 
 		 227 aa  96.7  3e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  29.68 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  29.07 
 
 		 250 aa  96.3  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 		 227 aa  95.9  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  32.68 
 
 		 240 aa  95.9  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  34 
 
 		 217 aa  94.7  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  32.02 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 		 234 aa  94.4  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  30.63 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  34.21 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  32.29 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.44 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  30.35 
 
 		 242 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  31.67 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 		 243 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  32.99 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>