More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3184 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
221 aa  429  1e-119  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  62.21 
 
 
224 aa  240  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  55.66 
 
 
237 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  54.98 
 
 
229 aa  211  7e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  54.98 
 
 
229 aa  210  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  51.39 
 
 
225 aa  202  4e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  51.42 
 
 
224 aa  180  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  45.97 
 
 
461 aa  152  4e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  44.02 
 
 
233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 
233 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 
230 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  38.16 
 
 
233 aa  139  3e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  40.37 
 
 
233 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  38.36 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  37.9 
 
 
234 aa  135  4e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 
228 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.64 
 
 
232 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  40.65 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 
227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  36.82 
 
 
227 aa  129  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 
233 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 
233 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 
227 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  40.36 
 
 
225 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  40.76 
 
 
223 aa  121  8e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  39.01 
 
 
225 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
231 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  36.97 
 
 
236 aa  118  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  35.19 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  36.15 
 
 
238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  39.19 
 
 
232 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  36.16 
 
 
218 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 
225 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  38.28 
 
 
231 aa  111  9e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  36.16 
 
 
218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  38.12 
 
 
224 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  38.07 
 
 
225 aa  109  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  38.12 
 
 
229 aa  109  3e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  37.61 
 
 
238 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  36.68 
 
 
221 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  34.6 
 
 
272 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  34.23 
 
 
250 aa  107  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  37.7 
 
 
250 aa  107  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  34.12 
 
 
272 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  39.23 
 
 
222 aa  105  7e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  34.27 
 
 
227 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  34.27 
 
 
227 aa  104  8e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
227 aa  103  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 
272 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  35.62 
 
 
213 aa  103  3e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  32.87 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 
226 aa  102  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 
272 aa  102  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 
272 aa  101  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 
227 aa  101  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  30.36 
 
 
272 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 
266 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  31.13 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  30.53 
 
 
230 aa  99.4  4e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  38.27 
 
 
219 aa  99  4e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  35.21 
 
 
217 aa  98.6  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  34.45 
 
 
223 aa  98.6  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  31.19 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  33.04 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  35.79 
 
 
229 aa  97.4  1e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  36.16 
 
 
228 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  36.6 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  33.82 
 
 
272 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  32.89 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 
221 aa  96.3  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
251 aa  95.5  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.77 
 
 
211 aa  95.1  6e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
251 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 
233 aa  94.7  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  33.03 
 
 
226 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
254 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 
224 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 
237 aa  94.7  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 
225 aa  94.7  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  30.18 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  30.26 
 
 
242 aa  94  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  29.55 
 
 
225 aa  94  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
229 aa  94  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  32.65 
 
 
235 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  35.32 
 
 
237 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  36.51 
 
 
221 aa  93.2  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 
256 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  35.42 
 
 
238 aa  92.4  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  28.81 
 
 
233 aa  92.8  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  35.42 
 
 
227 aa  92.8  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  26.99 
 
 
226 aa  92.4  5e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  32.7 
 
 
221 aa  92  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  32.46 
 
 
214 aa  92  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  27.88 
 
 
232 aa  92  7e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  31.77 
 
 
227 aa  91.7  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  34.26 
 
 
229 aa  91.7  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>