More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1166 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  100 
 
 		 229 aa  454  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  98.25 
 
 		 229 aa  448  1e-125  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  86.4 
 
 		 237 aa  396  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  65.24 
 
 		 224 aa  248  8e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  64.09 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  54.09 
 
 		 225 aa  227  1e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  54.98 
 
 		 221 aa  195  5.000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  39.55 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  40.37 
 
 		 231 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  43.06 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 233 aa  151  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  42.2 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  42.2 
 
 		 461 aa  144  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  38.39 
 
 		 234 aa  141  6e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  42.22 
 
 		 236 aa  141  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  40.37 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  40.37 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  37.91 
 
 		 234 aa  139  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.15 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  41.18 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  40.89 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  40.72 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  38.99 
 
 		 233 aa  132  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  39.01 
 
 		 225 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  39.47 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  39.01 
 
 		 225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 		 227 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 		 227 aa  128  9.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  38.99 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  36.11 
 
 		 227 aa  125  4.0000000000000003e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  39.55 
 
 		 218 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  38.68 
 
 		 231 aa  122  3e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.39 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  39.27 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 		 224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  39.09 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  33.94 
 
 		 227 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  33.94 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  39.53 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  32.71 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  35.45 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  41.98 
 
 		 223 aa  110  1.0000000000000001e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  38.74 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  39.29 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 226 aa  106  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  36.62 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  30.74 
 
 		 225 aa  105  5e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  30.49 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 272 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  32.2 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  34.88 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  30.09 
 
 		 229 aa  101  9e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  32.46 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  34 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  34.42 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 		 226 aa  99.4  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 		 226 aa  99  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 234 aa  98.6  7e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  34.39 
 
 		 227 aa  98.6  8e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 		 229 aa  98.2  8e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 		 272 aa  98.6  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  36.17 
 
 		 217 aa  97.8  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.17 
 
 		 235 aa  98.2  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 		 272 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  30.49 
 
 		 242 aa  97.8  1e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 266 aa  97.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 		 230 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  35.62 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 		 228 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  26.82 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  34.54 
 
 		 224 aa  96.3  3e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  31.43 
 
 		 216 aa  96.3  4e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 235 aa  95.5  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  35.45 
 
 		 213 aa  95.1  8e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  25.45 
 
 		 232 aa  94.7  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  35.23 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  30.26 
 
 		 250 aa  94.7  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 		 240 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  32.76 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  30.64 
 
 		 262 aa  93.6  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  34.51 
 
 		 235 aa  93.6  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  32.66 
 
 		 214 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 225 aa  93.6  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  28.17 
 
 		 227 aa  92.8  4e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  29.19 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  32.39 
 
 		 227 aa  92.4  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  33.63 
 
 		 243 aa  92.4  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  27.7 
 
 		 227 aa  92  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  32.21 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  26.58 
 
 		 225 aa  91.3  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>