More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0617 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  100 
 
 		 224 aa  434  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  66.82 
 
 		 237 aa  257  8e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  64.09 
 
 		 229 aa  251  4.0000000000000004e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  64.09 
 
 		 229 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  60.93 
 
 		 224 aa  224  1e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  51.82 
 
 		 225 aa  207  8e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  51.42 
 
 		 221 aa  173  9.999999999999999e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  45.12 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  45.12 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  43.81 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  43.04 
 
 		 461 aa  142  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  43.19 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  42.72 
 
 		 233 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  43.66 
 
 		 233 aa  138  7e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  41.26 
 
 		 228 aa  134  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  37.39 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  39.73 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.63 
 
 		 232 aa  132  6e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  40.69 
 
 		 225 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  35.07 
 
 		 234 aa  124  8.000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  39.56 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  38.21 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  39.63 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  39.27 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  37.61 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  36.16 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  37.39 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  37.74 
 
 		 231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  38.92 
 
 		 218 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  36.94 
 
 		 218 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  37.16 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  34.56 
 
 		 229 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  35.07 
 
 		 221 aa  109  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  40.83 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.4 
 
 		 226 aa  108  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  38.57 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  36.18 
 
 		 229 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  36.14 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  39.11 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  31.31 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  34.42 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  40.38 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  35.62 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  38.68 
 
 		 225 aa  104  9e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  36.7 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  31.14 
 
 		 227 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 250 aa  103  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  38.12 
 
 		 221 aa  103  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 		 228 aa  102  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  35.75 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  31.19 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  37.39 
 
 		 256 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 232 aa  99.8  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  33.8 
 
 		 227 aa  99.4  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 		 235 aa  99.4  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  33.99 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  38.22 
 
 		 216 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  30.66 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  34.3 
 
 		 250 aa  98.2  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  38.46 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0456  phosphoglycolate phosphatase  40.58 
 
 		 170 aa  97.4  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  35.12 
 
 		 225 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  34.8 
 
 		 235 aa  96.3  3e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  34.87 
 
 		 237 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  35.58 
 
 		 226 aa  96.7  3e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  35.6 
 
 		 237 aa  95.9  5e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  37.37 
 
 		 222 aa  95.5  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 		 229 aa  95.1  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  30.94 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  36.99 
 
 		 231 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  33.96 
 
 		 251 aa  95.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.1 
 
 		 211 aa  94.7  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 		 251 aa  94.4  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  30.94 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  35.79 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 		 221 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  34.55 
 
 		 228 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 		 234 aa  92.8  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  36.87 
 
 		 257 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  36.73 
 
 		 256 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  35.9 
 
 		 246 aa  92  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 		 224 aa  92  6e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  30.94 
 
 		 225 aa  92  6e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>