More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2193 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
225 aa  447  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  89.24 
 
 
225 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  85.65 
 
 
225 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  74.44 
 
 
228 aa  331  5e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  72.04 
 
 
231 aa  316  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  73.76 
 
 
228 aa  311  5.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  71.3 
 
 
225 aa  300  9e-81  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50.93 
 
 
232 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  52.51 
 
 
230 aa  221  6e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  50.45 
 
 
233 aa  211  5.999999999999999e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  50.68 
 
 
233 aa  207  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  46.58 
 
 
227 aa  206  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  50.67 
 
 
233 aa  206  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  47.98 
 
 
233 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  47.98 
 
 
233 aa  202  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  47.44 
 
 
237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  46.45 
 
 
231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 
234 aa  195  5.000000000000001e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  44.55 
 
 
233 aa  194  7e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  48.65 
 
 
227 aa  194  7e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 
234 aa  194  8.000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  43.38 
 
 
236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  42.15 
 
 
227 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  46.54 
 
 
238 aa  181  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  42.79 
 
 
238 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  46.76 
 
 
461 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  53.64 
 
 
232 aa  166  2.9999999999999998e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  42.66 
 
 
223 aa  145  4.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  38.54 
 
 
250 aa  145  6e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  43.58 
 
 
222 aa  142  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  39.78 
 
 
218 aa  137  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.82 
 
 
222 aa  135  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 
226 aa  134  9e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  40.18 
 
 
224 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  38.21 
 
 
229 aa  132  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.07 
 
 
222 aa  128  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  36.67 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  36.67 
 
 
227 aa  126  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  38.68 
 
 
226 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  37.96 
 
 
221 aa  122  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  39.27 
 
 
229 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  39.27 
 
 
229 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  37.14 
 
 
223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 
232 aa  119  4.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 
224 aa  118  6e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  39.69 
 
 
216 aa  118  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  36.08 
 
 
214 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  37.73 
 
 
237 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35.43 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  37.26 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  36.2 
 
 
227 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  37.76 
 
 
229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  35.02 
 
 
225 aa  112  3e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  35.85 
 
 
229 aa  113  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 
218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  36.24 
 
 
218 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  34.31 
 
 
226 aa  112  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  34.27 
 
 
225 aa  112  6e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
235 aa  111  9e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  37.7 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  35 
 
 
228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  35.78 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
226 aa  108  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  37 
 
 
256 aa  108  5e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  34.21 
 
 
228 aa  108  5e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 
272 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  31 
 
 
232 aa  108  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  34.55 
 
 
235 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  36.11 
 
 
221 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  36.15 
 
 
272 aa  108  9.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  32.83 
 
 
231 aa  107  1e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  34.56 
 
 
224 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  39.27 
 
 
224 aa  107  2e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  34.12 
 
 
227 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 
272 aa  106  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  34.56 
 
 
229 aa  106  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  34.91 
 
 
266 aa  105  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
238 aa  105  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  38.32 
 
 
233 aa  105  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 
229 aa  105  4e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
227 aa  105  5e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  39.9 
 
 
234 aa  105  5e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 
272 aa  105  6e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  34.27 
 
 
272 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 
225 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 
225 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 
225 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 
232 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 
221 aa  104  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 
250 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>