More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0954 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 233 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  83.69 
 
 		 233 aa  388  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  68.75 
 
 		 230 aa  295  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  67.42 
 
 		 233 aa  280  2e-74  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  65.61 
 
 		 233 aa  277  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  65.16 
 
 		 233 aa  276  2e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  58.22 
 
 		 232 aa  261  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  59.62 
 
 		 234 aa  251  7e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  59.15 
 
 		 234 aa  250  2e-65  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  56.42 
 
 		 227 aa  248  5e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  57.14 
 
 		 233 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  58.02 
 
 		 231 aa  230  1e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  50.66 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  52.04 
 
 		 225 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  50.45 
 
 		 225 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  51.13 
 
 		 225 aa  209  3e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  48.17 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  50.48 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  49.77 
 
 		 238 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  50.68 
 
 		 228 aa  199  3e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  49.77 
 
 		 231 aa  194  8.000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  48.39 
 
 		 227 aa  192  5e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  49.08 
 
 		 238 aa  191  8e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  47.96 
 
 		 228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  47.69 
 
 		 461 aa  177  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  48.9 
 
 		 232 aa  174  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  46.08 
 
 		 224 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  41.74 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  41.18 
 
 		 229 aa  136  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  45.12 
 
 		 224 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  45.75 
 
 		 222 aa  135  5e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  40.72 
 
 		 229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 		 227 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  43.81 
 
 		 225 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  40.19 
 
 		 237 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  34.4 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  39.52 
 
 		 226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  41.12 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  36.84 
 
 		 227 aa  125  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.1 
 
 		 226 aa  125  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 235 aa  124  9e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  34.09 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  45.21 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  40.96 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  36.84 
 
 		 231 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  35.57 
 
 		 229 aa  122  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  34.1 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 228 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  34.1 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  32.88 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  38.28 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  36.87 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  36.87 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 		 225 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  38.57 
 
 		 229 aa  118  9e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  35.08 
 
 		 214 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  38.62 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.55 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  35.04 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 		 227 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  37.81 
 
 		 257 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  34.27 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  33.97 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  35.21 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  35.21 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  35.21 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  34.25 
 
 		 272 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  37.37 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.75 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 216 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  34.25 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  36.87 
 
 		 221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 		 272 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  35.79 
 
 		 228 aa  109  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 226 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  31.9 
 
 		 223 aa  109  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 		 232 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  36.97 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  38.12 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 		 250 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>