More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_1295 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  100 
 
 		 224 aa  439  9.999999999999999e-123  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  65.9 
 
 		 237 aa  279  3e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  65.24 
 
 		 229 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  64.29 
 
 		 229 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  64.06 
 
 		 225 aa  256  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  62.21 
 
 		 221 aa  236  2e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  60.93 
 
 		 224 aa  231  8.000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  46.54 
 
 		 461 aa  167  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  44.04 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  46.12 
 
 		 233 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  40.27 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  46.08 
 
 		 233 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  39.42 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  42.15 
 
 		 228 aa  149  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 		 227 aa  148  8e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.12 
 
 		 232 aa  148  8e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  41.89 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  38.64 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  42.34 
 
 		 225 aa  145  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  39.52 
 
 		 237 aa  145  5e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  40.64 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  40.55 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  42.06 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  42.06 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  39.72 
 
 		 236 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  39.25 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  39.51 
 
 		 231 aa  125  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  38.81 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 		 250 aa  119  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 218 aa  112  5e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  41.1 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  40.43 
 
 		 250 aa  112  7.000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  38.81 
 
 		 232 aa  111  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 228 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  38.43 
 
 		 222 aa  109  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 		 217 aa  108  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 227 aa  108  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  29.2 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  35.64 
 
 		 214 aa  106  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  37.91 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  38.07 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  32.88 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  35.06 
 
 		 257 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  36.51 
 
 		 224 aa  102  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  32.37 
 
 		 225 aa  103  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  36.51 
 
 		 229 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  34.04 
 
 		 216 aa  102  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  32.14 
 
 		 226 aa  102  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 		 221 aa  102  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  35.96 
 
 		 219 aa  101  8e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  30.36 
 
 		 227 aa  101  9e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  36.18 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  30.7 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  36.63 
 
 		 226 aa  99.8  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  29.55 
 
 		 225 aa  99.8  3e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  32.23 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 		 226 aa  98.6  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  35.53 
 
 		 223 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 		 225 aa  98.2  9e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  37.82 
 
 		 219 aa  98.2  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 		 225 aa  97.4  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 		 250 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.86 
 
 		 211 aa  97.1  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0456  phosphoglycolate phosphatase  39.22 
 
 		 170 aa  96.3  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0719928 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  36.22 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 		 228 aa  96.7  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  38.01 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  34.12 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  34.52 
 
 		 223 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  28.83 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  36.68 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 		 235 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 		 234 aa  95.5  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 		 226 aa  95.5  6e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  28.84 
 
 		 232 aa  95.5  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  34.52 
 
 		 223 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  37.7 
 
 		 231 aa  95.1  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  35.11 
 
 		 228 aa  95.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>