More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1573 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
229 aa  464  9.999999999999999e-131  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  98.66 
 
 
224 aa  447  1e-125  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  70.35 
 
 
250 aa  320  9.999999999999999e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2739  phosphoglycolate phosphatase  68.35 
 
 
231 aa  293  1e-78  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  42.58 
 
 
223 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  42.58 
 
 
226 aa  175  5e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  45.15 
 
 
223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  47.34 
 
 
221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  41.95 
 
 
234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  45.75 
 
 
218 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  43.2 
 
 
226 aa  169  4e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  43.63 
 
 
238 aa  164  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  43.63 
 
 
227 aa  164  8e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 
223 aa  162  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  41.71 
 
 
218 aa  163  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0909  phosphoglycolate phosphatase  43.06 
 
 
222 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  44.29 
 
 
221 aa  160  2e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1741  phosphoglycolate phosphatase  42.31 
 
 
223 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  42.72 
 
 
222 aa  158  7e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  41.2 
 
 
225 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  41.78 
 
 
223 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0897  hydrolase protein  47.57 
 
 
229 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00554563  normal  0.72661 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  41.78 
 
 
223 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3651  phosphoglycolate phosphatase  41.35 
 
 
223 aa  155  4e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  40.76 
 
 
223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  42.18 
 
 
237 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 
225 aa  154  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 
228 aa  153  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  41.31 
 
 
223 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  46.12 
 
 
229 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  46.08 
 
 
228 aa  150  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  40.78 
 
 
223 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0490  phosphoglycolate phosphatase  39.71 
 
 
224 aa  148  5e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155705  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  43 
 
 
227 aa  149  5e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  39.9 
 
 
221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  41.63 
 
 
237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  38.92 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  44.98 
 
 
241 aa  145  5e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1575  phosphoglycolate phosphatase  40.49 
 
 
229 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.099799  unclonable  0.000000163733 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  41.98 
 
 
221 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  38.05 
 
 
219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2893  phosphoglycolate phosphatase  44.98 
 
 
241 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3004  phosphoglycolate phosphatase  44.98 
 
 
241 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2955  phosphoglycolate phosphatase  44.98 
 
 
241 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0957  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 
241 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.753227  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2583  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 
241 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0438  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 
241 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2185  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
215 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.279465  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0190  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 
241 aa  143  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1950  HAD family hydrolase  39.5 
 
 
228 aa  143  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0253028  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  39.32 
 
 
221 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 
237 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0131  HAD family hydrolase  37.05 
 
 
236 aa  142  3e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  39.72 
 
 
221 aa  141  7e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1729  phosphoglycolate phosphatase  40.39 
 
 
213 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.970974  hitchhiker  0.00217318 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0122  haloacid dehalogenase-like hydrolase  36.61 
 
 
236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.817509  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  38.94 
 
 
222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  37.73 
 
 
224 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2061  HAD family hydrolase  38.64 
 
 
224 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0183643  unclonable  0.0000224709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1917  HAD family hydrolase  38.71 
 
 
224 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0123365  hitchhiker  0.0000000762533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2414  phosphoglycolate phosphatase, putative  38.57 
 
 
229 aa  137  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 
221 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  39.72 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  37.25 
 
 
220 aa  135  4e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2235  phosphoglycolate phosphatase 2  42.31 
 
 
223 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0682937  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0996  phosphoglycolate phosphatase  43.13 
 
 
237 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.137981  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2072  HAD family hydrolase  36.87 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000098787  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  35.35 
 
 
230 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 
224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0917  phosphoglycolate phosphatase  44.17 
 
 
238 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0326596 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  40.29 
 
 
233 aa  132  3e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0913  phosphoglycolate phosphatase  43.78 
 
 
238 aa  132  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0558  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1037  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 
237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0576  phosphoglycolate phosphatase  43.9 
 
 
230 aa  132  5e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.475969  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4150  2-phosphoglycolate phosphatase  41.55 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  34.63 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  36.65 
 
 
223 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  36.65 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  36.65 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.65 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  33.94 
 
 
235 aa  125  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 
226 aa  124  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  35.32 
 
 
218 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  38.57 
 
 
227 aa  124  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  33.49 
 
 
228 aa  121  8e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2267  phosphoglycolate phosphatase  44.33 
 
 
238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.428353  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  33.17 
 
 
234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 
226 aa  119  4.9999999999999996e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  37.19 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
225 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  38.03 
 
 
222 aa  116  3e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  37.63 
 
 
237 aa  115  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  34.3 
 
 
240 aa  115  5e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  37.7 
 
 
225 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  35.5 
 
 
250 aa  115  7.999999999999999e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  34.22 
 
 
227 aa  114  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 
227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>