More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4023 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 227 aa  458  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  50.73 
 
 		 218 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  46.98 
 
 		 213 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  48.13 
 
 		 218 aa  168  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  45.71 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  43.72 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  41.12 
 
 		 256 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  36.74 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  38.01 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 		 272 aa  126  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 		 230 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  39.44 
 
 		 461 aa  123  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  41.54 
 
 		 235 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  38.14 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  39.35 
 
 		 272 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  35.21 
 
 		 224 aa  123  3e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  39.89 
 
 		 216 aa  122  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 		 230 aa  121  9e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  38.57 
 
 		 216 aa  121  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  40.72 
 
 		 233 aa  121  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  41.75 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.65 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 		 225 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  37.96 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  39.05 
 
 		 229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  39.58 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  35.85 
 
 		 227 aa  118  6e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  37.96 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  34.39 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  39.58 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  39.58 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  38.73 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  36.7 
 
 		 272 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  38.86 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  35.78 
 
 		 266 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  34.5 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  40.21 
 
 		 250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  40.51 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 		 226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  34.42 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  34.42 
 
 		 227 aa  112  5e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  37.82 
 
 		 235 aa  111  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  37.26 
 
 		 234 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  34.5 
 
 		 241 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  35.93 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  35.2 
 
 		 225 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  35.93 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  34.85 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  39.69 
 
 		 228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 		 225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  34.39 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  34.82 
 
 		 246 aa  107  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  34.45 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  34.18 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  35.6 
 
 		 238 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  36.73 
 
 		 229 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  35.89 
 
 		 256 aa  106  3e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  34.16 
 
 		 223 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 		 225 aa  105  4e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  36.55 
 
 		 228 aa  105  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  34.55 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  33.97 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  33.97 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  33.97 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  32.71 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  34.52 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  36.73 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  34.29 
 
 		 246 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  31.82 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 		 233 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 		 252 aa  102  5e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  34.13 
 
 		 252 aa  102  6e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  32.24 
 
 		 228 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 		 252 aa  102  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>