More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2878 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
226 aa  456  1e-127  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  77.48 
 
 
227 aa  359  2e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  64.29 
 
 
225 aa  307  6.999999999999999e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  63.76 
 
 
227 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  58.93 
 
 
225 aa  287  7e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  47.73 
 
 
227 aa  216  2e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  49.29 
 
 
227 aa  214  9.999999999999999e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  49.1 
 
 
228 aa  210  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  51.39 
 
 
272 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  52.13 
 
 
272 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  50.69 
 
 
229 aa  206  2e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  50.93 
 
 
272 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  49.07 
 
 
266 aa  201  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  50.93 
 
 
226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  48.21 
 
 
229 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  48.6 
 
 
272 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  50.47 
 
 
227 aa  196  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  49.33 
 
 
272 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  49.54 
 
 
272 aa  194  8.000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  47.17 
 
 
226 aa  194  9e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  49.29 
 
 
272 aa  194  9e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  46.12 
 
 
227 aa  194  1e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  45.79 
 
 
225 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  45.79 
 
 
225 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  48.34 
 
 
272 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  45.79 
 
 
225 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  45.79 
 
 
225 aa  192  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  43.3 
 
 
225 aa  191  7e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  46.7 
 
 
227 aa  191  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  46.7 
 
 
227 aa  191  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  46.23 
 
 
227 aa  190  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  50 
 
 
223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  43.38 
 
 
235 aa  189  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  44.44 
 
 
227 aa  188  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  44.44 
 
 
227 aa  188  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  45.7 
 
 
232 aa  186  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  44.34 
 
 
227 aa  185  5e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  44.69 
 
 
226 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  45.79 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  45.21 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  44.29 
 
 
235 aa  181  6e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  41.74 
 
 
242 aa  178  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  42.67 
 
 
231 aa  178  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  40.91 
 
 
226 aa  177  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  40.27 
 
 
232 aa  176  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  47 
 
 
224 aa  175  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 
225 aa  172  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  48.6 
 
 
233 aa  171  6.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  42.25 
 
 
227 aa  171  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  41.9 
 
 
230 aa  169  3e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  40.53 
 
 
241 aa  168  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  40.93 
 
 
254 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  40.93 
 
 
254 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  40.93 
 
 
254 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 
261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  45.93 
 
 
233 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 
225 aa  164  8e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  43.52 
 
 
246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  43 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  45.54 
 
 
232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  42.86 
 
 
235 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 
251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  40.93 
 
 
256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
251 aa  162  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  39.23 
 
 
240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  44.5 
 
 
221 aa  161  9e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 
234 aa  160  1e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
242 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
242 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
242 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
245 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
242 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 
234 aa  160  2e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
245 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 
242 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  40.36 
 
 
241 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  41.85 
 
 
229 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  43.06 
 
 
243 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  43.06 
 
 
248 aa  157  9e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  40 
 
 
233 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 
242 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 
252 aa  156  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 
252 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 
252 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  42.6 
 
 
250 aa  156  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
238 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 
252 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 
252 aa  156  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
238 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  42.11 
 
 
252 aa  156  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 
252 aa  155  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  42.36 
 
 
253 aa  155  4e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 
252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 
252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 
252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 
252 aa  155  5.0000000000000005e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 
252 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 
252 aa  155  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  41.67 
 
 
252 aa  155  6e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>