More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03140 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  55.35 
 
 
229 aa  230  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  44.55 
 
 
227 aa  178  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  44.81 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  46.95 
 
 
227 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  44.81 
 
 
225 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  44.81 
 
 
225 aa  171  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  44.81 
 
 
225 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  44.86 
 
 
235 aa  171  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  44.81 
 
 
225 aa  169  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 
227 aa  169  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  43.6 
 
 
226 aa  168  5e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  44.13 
 
 
227 aa  167  9e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 
235 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  44.34 
 
 
227 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  43.87 
 
 
227 aa  165  4e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  43.6 
 
 
227 aa  165  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  42.06 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 
225 aa  159  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  43.93 
 
 
227 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  43.93 
 
 
227 aa  159  3e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  45.93 
 
 
223 aa  159  3e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 
225 aa  157  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  43.13 
 
 
228 aa  156  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  40.85 
 
 
272 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 
226 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  40.85 
 
 
272 aa  155  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  41.44 
 
 
272 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 
272 aa  154  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  41.44 
 
 
272 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 
225 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  39.17 
 
 
225 aa  153  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  42.06 
 
 
272 aa  153  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  40.57 
 
 
233 aa  152  4e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  41.44 
 
 
232 aa  152  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  40.65 
 
 
229 aa  152  4e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  39.72 
 
 
266 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  39.64 
 
 
232 aa  151  5.9999999999999996e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  44.15 
 
 
221 aa  151  7e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  39.72 
 
 
272 aa  151  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  42.52 
 
 
229 aa  151  8e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  42.08 
 
 
227 aa  150  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 
226 aa  150  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  41.4 
 
 
226 aa  148  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 
227 aa  147  9e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 
229 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  40.54 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  39.17 
 
 
230 aa  145  5e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  39.63 
 
 
225 aa  145  5e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 
232 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  36.84 
 
 
253 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
252 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
252 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  41.15 
 
 
225 aa  138  6e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
252 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
252 aa  138  6e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  38.53 
 
 
228 aa  138  7.999999999999999e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  37.89 
 
 
252 aa  136  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
252 aa  136  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
252 aa  136  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  35.93 
 
 
224 aa  136  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  39.71 
 
 
224 aa  136  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
252 aa  136  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  38.33 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  42.25 
 
 
234 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
238 aa  134  8e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  42.25 
 
 
256 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  38.86 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 
227 aa  134  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  38.57 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  36.07 
 
 
223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 
242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 
242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 
242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 
242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 
242 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 
245 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 
245 aa  132  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  38.29 
 
 
241 aa  132  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
238 aa  131  7.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  35.92 
 
 
242 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  38.54 
 
 
240 aa  131  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  39.52 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  39.52 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  35.1 
 
 
226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  39.52 
 
 
232 aa  130  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  37.84 
 
 
261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 
228 aa  129  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  42.16 
 
 
213 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  39.53 
 
 
233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  40.87 
 
 
232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 
242 aa  129  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  37.16 
 
 
228 aa  128  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>