More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0382 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
229 aa  471  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  65.47 
 
 
235 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  67.87 
 
 
227 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  67.71 
 
 
227 aa  301  5.000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  67.87 
 
 
227 aa  300  9e-81  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  65.62 
 
 
225 aa  300  1e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  67.42 
 
 
227 aa  300  1e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  64.73 
 
 
225 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  65.18 
 
 
226 aa  296  1e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  64.73 
 
 
225 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  64.73 
 
 
225 aa  297  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  63.68 
 
 
227 aa  289  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  60.35 
 
 
235 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  64.63 
 
 
228 aa  277  9e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  62.16 
 
 
231 aa  274  8e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  63.68 
 
 
232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  48.43 
 
 
225 aa  211  5.999999999999999e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  47.75 
 
 
225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  47.27 
 
 
224 aa  196  2.0000000000000003e-49  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  46.85 
 
 
226 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  44.84 
 
 
234 aa  194  1e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  48.66 
 
 
226 aa  193  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  44.39 
 
 
234 aa  188  5e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  44.39 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  47.27 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  44.39 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  44.39 
 
 
232 aa  183  2.0000000000000003e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  47 
 
 
227 aa  182  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  47.03 
 
 
225 aa  182  3e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  42.6 
 
 
232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  45.5 
 
 
226 aa  182  5.0000000000000004e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  46.67 
 
 
232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  44.93 
 
 
227 aa  181  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  43.23 
 
 
232 aa  181  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  45.29 
 
 
228 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 
252 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 
252 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 
252 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  43.04 
 
 
252 aa  177  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  42.41 
 
 
233 aa  177  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  42.32 
 
 
253 aa  176  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  44.84 
 
 
228 aa  176  3e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
252 aa  176  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
252 aa  176  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
252 aa  176  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
252 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  42.62 
 
 
252 aa  176  4e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  42.62 
 
 
252 aa  176  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 
272 aa  174  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  42.19 
 
 
252 aa  174  8e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  44.04 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  42.47 
 
 
272 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  42.19 
 
 
252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  41.15 
 
 
229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  41.77 
 
 
252 aa  172  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  42.92 
 
 
227 aa  172  5e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  43.72 
 
 
272 aa  171  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  43.19 
 
 
272 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  42.47 
 
 
226 aa  170  2e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 
227 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 
227 aa  169  3e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  43.19 
 
 
272 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  41.04 
 
 
229 aa  168  5e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  41.85 
 
 
226 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  43.19 
 
 
272 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  42.25 
 
 
272 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  40.76 
 
 
266 aa  159  2e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  41.28 
 
 
225 aa  159  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  42.33 
 
 
272 aa  158  8e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  39.82 
 
 
225 aa  157  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  40.39 
 
 
227 aa  155  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  38.12 
 
 
242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  42.52 
 
 
216 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  42.18 
 
 
233 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  40.39 
 
 
227 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  41.24 
 
 
227 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  40.99 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  39.71 
 
 
238 aa  145  5e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
226 aa  145  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
242 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 
256 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
245 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
242 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
242 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  38.73 
 
 
238 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
242 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
242 aa  144  2e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  38.89 
 
 
250 aa  144  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
245 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  39.29 
 
 
221 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
254 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
254 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
254 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
254 aa  141  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
251 aa  141  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 
242 aa  141  8e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  40.39 
 
 
214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  39.63 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  38.24 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>