More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_3582 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
245 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
245 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  99.59 
 
 
242 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
242 aa  489  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  99.59 
 
 
242 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  99.59 
 
 
242 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  99.59 
 
 
242 aa  488  1e-137  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  93.8 
 
 
242 aa  453  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  81.42 
 
 
254 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  81.33 
 
 
254 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  81.33 
 
 
254 aa  367  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  75.42 
 
 
238 aa  364  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  75 
 
 
238 aa  362  3e-99  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  79.11 
 
 
256 aa  362  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  80.44 
 
 
251 aa  362  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  80.36 
 
 
254 aa  361  5.0000000000000005e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  79.56 
 
 
251 aa  358  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  73.06 
 
 
240 aa  327  9e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  50.87 
 
 
241 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  54.32 
 
 
243 aa  227  1e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  54.31 
 
 
246 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  53.91 
 
 
248 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  50.87 
 
 
246 aa  222  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  50.22 
 
 
234 aa  209  3e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  48 
 
 
242 aa  205  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  48.39 
 
 
225 aa  204  9e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  50.45 
 
 
250 aa  204  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  46.47 
 
 
262 aa  203  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  48.25 
 
 
235 aa  194  8.000000000000001e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  45.95 
 
 
241 aa  189  4e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  45.95 
 
 
261 aa  188  7e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  48.1 
 
 
221 aa  186  4e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  44.2 
 
 
233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  43.32 
 
 
227 aa  176  4e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  40.55 
 
 
227 aa  171  6.999999999999999e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  45.33 
 
 
224 aa  170  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
232 aa  168  8e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  40.64 
 
 
230 aa  167  1e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  42.5 
 
 
225 aa  165  5e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  39.35 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 
225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 
229 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 
226 aa  162  6e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 
225 aa  159  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  41.31 
 
 
228 aa  157  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  38.01 
 
 
227 aa  156  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  39.34 
 
 
229 aa  157  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  37.69 
 
 
225 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  37.19 
 
 
225 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  37.19 
 
 
225 aa  149  3e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  40.76 
 
 
226 aa  149  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  35.32 
 
 
227 aa  149  4e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 
235 aa  148  9e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  37.19 
 
 
225 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  36.94 
 
 
227 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  36.02 
 
 
227 aa  146  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  40.85 
 
 
226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  35.32 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 
228 aa  144  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 
272 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 
225 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  34.86 
 
 
227 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 
228 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 
272 aa  142  4e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  36.68 
 
 
226 aa  142  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 
272 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 
272 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 
235 aa  142  7e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  37.81 
 
 
231 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  34.88 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  42.35 
 
 
233 aa  140  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 
225 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  37.02 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 
229 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 
223 aa  133  3e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  35.85 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  36.63 
 
 
226 aa  129  4.0000000000000003e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  34.42 
 
 
272 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  35.07 
 
 
266 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  33.94 
 
 
227 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  33.94 
 
 
227 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  32.23 
 
 
224 aa  128  8.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  34.93 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  32.58 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  32.62 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  35.92 
 
 
216 aa  126  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  35.19 
 
 
250 aa  124  1e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 
226 aa  124  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  34.07 
 
 
252 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  38.81 
 
 
238 aa  123  2e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  32.84 
 
 
232 aa  124  2e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 
233 aa  124  2e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  37.32 
 
 
228 aa  122  5e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  33.63 
 
 
252 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  32.39 
 
 
252 aa  122  6e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>