More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2110 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
225 aa  463  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  58.93 
 
 
226 aa  287  7e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  61.19 
 
 
227 aa  286  2e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  58.99 
 
 
227 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  57.33 
 
 
225 aa  279  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  54.71 
 
 
228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  45.91 
 
 
227 aa  215  5e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  45.5 
 
 
227 aa  201  7e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  46.3 
 
 
229 aa  199  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  46.26 
 
 
266 aa  191  5e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  44.86 
 
 
272 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  42.66 
 
 
227 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  42.66 
 
 
227 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  45.97 
 
 
272 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  43.84 
 
 
235 aa  185  6e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  46.45 
 
 
225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  45.16 
 
 
229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  45.5 
 
 
272 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  45.5 
 
 
272 aa  182  3e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  45.97 
 
 
225 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  45.97 
 
 
225 aa  181  7e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  45.5 
 
 
231 aa  180  2e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  43.87 
 
 
227 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  45.28 
 
 
225 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  43.64 
 
 
227 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  43.24 
 
 
224 aa  178  5.999999999999999e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  43.18 
 
 
227 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  45.97 
 
 
272 aa  177  2e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  43.98 
 
 
226 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  44.55 
 
 
227 aa  176  3e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  43.18 
 
 
227 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  44.93 
 
 
226 aa  175  4e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  44.86 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  42.01 
 
 
235 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  42.47 
 
 
228 aa  169  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  42.52 
 
 
272 aa  168  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  43.93 
 
 
223 aa  168  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  41.59 
 
 
272 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  41.26 
 
 
272 aa  164  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  38.74 
 
 
241 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  39.55 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 
230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  39.45 
 
 
232 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  40.19 
 
 
233 aa  163  3e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  40.38 
 
 
225 aa  160  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  38.33 
 
 
242 aa  160  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  43.93 
 
 
233 aa  159  2e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
242 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
242 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
245 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  41.12 
 
 
225 aa  160  2e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
245 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  38.39 
 
 
225 aa  160  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
242 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
242 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
242 aa  160  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  37.9 
 
 
227 aa  159  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  41.44 
 
 
232 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  41.44 
 
 
232 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  41.44 
 
 
232 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 
254 aa  159  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  38.94 
 
 
251 aa  158  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  41.01 
 
 
234 aa  158  5e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  39.25 
 
 
226 aa  158  6e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  41.47 
 
 
234 aa  158  8e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  38.94 
 
 
251 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  36.57 
 
 
242 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  39.17 
 
 
246 aa  156  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  40.47 
 
 
232 aa  156  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  36.11 
 
 
238 aa  155  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  37.86 
 
 
256 aa  155  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  39.64 
 
 
228 aa  155  6e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  35.65 
 
 
238 aa  155  7e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 
254 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
225 aa  154  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  39.17 
 
 
248 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 
254 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 
254 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  40.67 
 
 
221 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  34.93 
 
 
240 aa  153  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  37.84 
 
 
228 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  38.36 
 
 
262 aa  152  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 
243 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 
216 aa  151  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  39.91 
 
 
232 aa  151  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  38.97 
 
 
227 aa  151  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  37.96 
 
 
229 aa  151  8e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  39.82 
 
 
229 aa  150  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  40.09 
 
 
234 aa  150  2e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 
232 aa  150  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
233 aa  149  3e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  40.76 
 
 
226 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
235 aa  148  6e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  37.28 
 
 
246 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  36.82 
 
 
241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  39.37 
 
 
250 aa  145  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  37.23 
 
 
252 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  37.23 
 
 
252 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  36.2 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  36.53 
 
 
228 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>