More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2479 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  43.84 
 
 		 227 aa  175  5e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 238 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  40.57 
 
 		 238 aa  161  7e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  40.57 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 		 251 aa  158  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  41.98 
 
 		 240 aa  157  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 		 254 aa  156  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  42.65 
 
 		 254 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  42.18 
 
 		 254 aa  155  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 		 242 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 		 242 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 		 242 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 		 242 aa  154  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  42.18 
 
 		 251 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 		 245 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  39.55 
 
 		 225 aa  153  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  40.95 
 
 		 242 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  41.75 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  39.81 
 
 		 242 aa  152  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  41.63 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  38.91 
 
 		 262 aa  150  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  41.9 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  37.72 
 
 		 241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  40.81 
 
 		 250 aa  147  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  36.82 
 
 		 232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3656  phosphoglycolate phosphatase  40.53 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.755729 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  38.74 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  39.52 
 
 		 227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  36.53 
 
 		 225 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  40.18 
 
 		 226 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  36.12 
 
 		 241 aa  139  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  42.06 
 
 		 246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  39.13 
 
 		 233 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 261 aa  137  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  38.64 
 
 		 235 aa  137  2e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  34.56 
 
 		 227 aa  135  4e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  39.3 
 
 		 246 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  40.28 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  37.67 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  40.65 
 
 		 243 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  34.01 
 
 		 230 aa  133  3e-30  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  38.01 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  40.65 
 
 		 248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  36.16 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  34.52 
 
 		 225 aa  131  9e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  37.96 
 
 		 257 aa  129  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  39.09 
 
 		 231 aa  128  6e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  38.54 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 226 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  36.5 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  38.54 
 
 		 232 aa  125  6e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  37.31 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  37.31 
 
 		 272 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  36.98 
 
 		 235 aa  123  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  36.67 
 
 		 228 aa  122  3e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 250 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  41.54 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  36.97 
 
 		 272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  35.08 
 
 		 225 aa  118  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  35.47 
 
 		 218 aa  119  6e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  37.82 
 
 		 272 aa  119  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  39.57 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  35.08 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  35.08 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  39.2 
 
 		 237 aa  117  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  38.94 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  35.07 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  34.12 
 
 		 228 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  39.59 
 
 		 243 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  35.08 
 
 		 225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  35.23 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  36.6 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  35.53 
 
 		 227 aa  116  3e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  36.6 
 
 		 272 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  35.91 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  38.02 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  35.81 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 		 272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  38.22 
 
 		 218 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  38.22 
 
 		 218 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  35.23 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 		 223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  37.11 
 
 		 232 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.35 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  35.98 
 
 		 227 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>