More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1008 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  98.72 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  84.05 
 
 		 233 aa  411  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  65.47 
 
 		 231 aa  291  6e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  59.62 
 
 		 233 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  57.67 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  53.98 
 
 		 230 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  48.71 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  50.22 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  52.07 
 
 		 237 aa  222  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50 
 
 		 232 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  48.65 
 
 		 227 aa  209  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  47.14 
 
 		 227 aa  205  5e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  48.08 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 		 225 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  44.39 
 
 		 225 aa  193  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  47.14 
 
 		 233 aa  192  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  46.67 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  43.46 
 
 		 225 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  45.07 
 
 		 231 aa  191  1e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  42.01 
 
 		 227 aa  187  1e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  47.14 
 
 		 233 aa  186  3e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  46.89 
 
 		 225 aa  185  6e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  44.98 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  42.4 
 
 		 461 aa  170  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  43.27 
 
 		 238 aa  168  7e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  47.35 
 
 		 232 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  40.31 
 
 		 250 aa  145  4.0000000000000006e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1198  phosphoglycolate phosphatase  38.68 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.042458  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  43.65 
 
 		 256 aa  141  9e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  37.91 
 
 		 229 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  37.7 
 
 		 217 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2015  HAD family hydrolase  37.91 
 
 		 237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.260233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 227 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1295  HAD-superfamily hydrolase  37.67 
 
 		 224 aa  135  7.000000000000001e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.647127  normal  0.296731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  32.26 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0729  HAD family hydrolase  34.82 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  39.62 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 		 235 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0969  phosphoglycolate phosphatase  37.14 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.829291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  36.68 
 
 		 227 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  38.42 
 
 		 231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 229 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  37.57 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  39.68 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3184  phosphoglycolate phosphatase  38.36 
 
 		 221 aa  127  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.903227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  38.16 
 
 		 272 aa  125  5e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  37.14 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  37.14 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  35.21 
 
 		 226 aa  125  7e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 224 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  37.62 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  36.46 
 
 		 214 aa  123  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  35.07 
 
 		 225 aa  124  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  34.02 
 
 		 229 aa  124  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  35.26 
 
 		 225 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  35.26 
 
 		 225 aa  122  7e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  35.26 
 
 		 228 aa  121  8e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  34.27 
 
 		 272 aa  121  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  34.27 
 
 		 272 aa  121  9e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  35.26 
 
 		 225 aa  121  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  34.95 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  35.79 
 
 		 229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  31.53 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  36.55 
 
 		 226 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.5 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  34.54 
 
 		 226 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 		 225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0617  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.422175  normal  0.344237 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  33.77 
 
 		 272 aa  118  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  33.77 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 		 225 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  34.95 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  39.36 
 
 		 209 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  34.02 
 
 		 227 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  32.88 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  35.48 
 
 		 272 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  30.45 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 		 227 aa  115  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  37.2 
 
 		 233 aa  115  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  38.62 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  35.65 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  35.32 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  44.21 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  32.44 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  35 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  32.44 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  31.43 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  32.44 
 
 		 232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>