More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2708 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2708  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 218 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.900688 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  87.16 
 
 		 218 aa  388  1e-107  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  86.7 
 
 		 218 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  48.13 
 
 		 227 aa  187  7e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  47.69 
 
 		 213 aa  175  4e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  45.54 
 
 		 221 aa  148  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  43.32 
 
 		 256 aa  147  8e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  42.16 
 
 		 272 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  42.42 
 
 		 272 aa  134  8e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  42.42 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  41.15 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  38.6 
 
 		 227 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  44.56 
 
 		 272 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  44.56 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  36.94 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 		 461 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  40.11 
 
 		 226 aa  128  6e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  38.97 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  38.97 
 
 		 227 aa  128  7.000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  38.71 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  39.39 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  39.63 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  41.21 
 
 		 272 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  36.67 
 
 		 234 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 		 226 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  38.66 
 
 		 231 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  36.67 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  35.68 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  40.19 
 
 		 257 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  34.84 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  36.08 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  36.08 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  36.08 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  35.02 
 
 		 238 aa  123  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  36.11 
 
 		 229 aa  122  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  41.51 
 
 		 216 aa  122  4e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  42.63 
 
 		 229 aa  122  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  44.67 
 
 		 234 aa  122  5e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  36.08 
 
 		 225 aa  122  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  42.19 
 
 		 233 aa  121  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  39.06 
 
 		 266 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  36.67 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  39.18 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  32.27 
 
 		 230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 		 228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  37.11 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  33.94 
 
 		 225 aa  119  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  37 
 
 		 238 aa  119  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  39.9 
 
 		 226 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  35.43 
 
 		 241 aa  118  7e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  35.57 
 
 		 238 aa  118  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  34.86 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  39.59 
 
 		 229 aa  118  7.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  37.73 
 
 		 257 aa  117  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  38.54 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  38.39 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1166  HAD family hydrolase  39.29 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.779812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.25 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 		 225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  35.9 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2504  phosphoglycolate phosphatase  39.29 
 
 		 229 aa  116  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.900598  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  38.86 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  32.27 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  37.85 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  34.56 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  32.81 
 
 		 225 aa  115  6e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 228 aa  115  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 		 226 aa  115  6e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  34.54 
 
 		 235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  38.02 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 		 238 aa  114  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  36.13 
 
 		 228 aa  114  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 227 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  39.27 
 
 		 228 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  31.82 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 242 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  38.81 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 242 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3611  phosphoglycolate phosphatase  35.19 
 
 		 262 aa  112  3e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 242 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3177  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 		 246 aa  113  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 242 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 		 251 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  39.58 
 
 		 246 aa  112  5e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  34.54 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 		 233 aa  112  6e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>