More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0783 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 222 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  89.64 
 
 		 222 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  57.94 
 
 		 214 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  58.69 
 
 		 223 aa  248  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  55.71 
 
 		 217 aa  230  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  49.49 
 
 		 218 aa  184  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  42 
 
 		 230 aa  149  5e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  38.18 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  43.23 
 
 		 226 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 225 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  43.68 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  39.8 
 
 		 227 aa  137  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  39.22 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  40.82 
 
 		 225 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  38.97 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  38.97 
 
 		 272 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  41.03 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  37.74 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  41.45 
 
 		 272 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 272 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  38.74 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  37.63 
 
 		 231 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  34.93 
 
 		 235 aa  132  5e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  41.67 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  41.45 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  39.8 
 
 		 225 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  38.39 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  38.22 
 
 		 224 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  41.29 
 
 		 233 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  38.79 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 272 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  36.6 
 
 		 228 aa  128  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  38.5 
 
 		 229 aa  128  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  38.02 
 
 		 226 aa  128  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  38.66 
 
 		 461 aa  128  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  39.29 
 
 		 225 aa  128  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.18 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  37.7 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  39.38 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  34.83 
 
 		 229 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  37.63 
 
 		 227 aa  126  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  41.88 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  34.3 
 
 		 233 aa  124  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  34.9 
 
 		 235 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 272 aa  124  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 		 226 aa  123  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  36.41 
 
 		 228 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  34.1 
 
 		 229 aa  123  3e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  35.03 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 228 aa  122  4e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  35.03 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  38.19 
 
 		 228 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 		 227 aa  122  6e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  34.52 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  39.78 
 
 		 209 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  34.8 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  37.05 
 
 		 233 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  34.52 
 
 		 225 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  36.55 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  36.13 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 		 227 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 		 227 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  36.46 
 
 		 227 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  39.35 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  36.13 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.08 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  33.5 
 
 		 234 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  34.55 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  34.01 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  35.53 
 
 		 226 aa  118  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  34.9 
 
 		 225 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  34.17 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  36.18 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 		 227 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  34.55 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  35.03 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.65 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 225 aa  116  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  36.46 
 
 		 229 aa  115  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  31.61 
 
 		 227 aa  114  7.999999999999999e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 		 227 aa  114  8.999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 		 227 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  36 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  36 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  36 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  32.81 
 
 		 215 aa  114  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  35.45 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  35.2 
 
 		 227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  40 
 
 		 209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.6 
 
 		 221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>