More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_00150 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  100 
 
 
218 aa  446  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  45.07 
 
 
216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.87 
 
 
218 aa  171  9e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.81 
 
 
217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  42.25 
 
 
217 aa  159  4e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  41.23 
 
 
229 aa  157  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.72 
 
 
220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  39.15 
 
 
225 aa  145  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.5 
 
 
219 aa  144  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  34.3 
 
 
216 aa  141  7e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.79 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.72 
 
 
219 aa  140  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  34.29 
 
 
215 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.09 
 
 
217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.74 
 
 
220 aa  132  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  39.15 
 
 
220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.27 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  38.68 
 
 
217 aa  128  7.000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  39.69 
 
 
223 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.68 
 
 
218 aa  125  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.11 
 
 
218 aa  125  7e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  36.67 
 
 
224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.27 
 
 
216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.65 
 
 
222 aa  116  3e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  34.3 
 
 
209 aa  115  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  34.3 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.38 
 
 
226 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 
461 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  33.82 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.93 
 
 
222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  34.72 
 
 
214 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  32.73 
 
 
227 aa  107  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.48 
 
 
217 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  34.16 
 
 
217 aa  107  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  29.72 
 
 
220 aa  106  3e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
231 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  34.22 
 
 
231 aa  104  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  34.58 
 
 
226 aa  103  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.66 
 
 
216 aa  103  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 
230 aa  103  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  32.56 
 
 
218 aa  102  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  32.02 
 
 
239 aa  101  8e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  32.42 
 
 
227 aa  101  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  34.34 
 
 
233 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.2 
 
 
233 aa  98.2  9e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  31.51 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  31.92 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 
257 aa  96.3  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  32.52 
 
 
233 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  34.63 
 
 
227 aa  96.3  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
231 aa  95.9  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 
225 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  31.05 
 
 
227 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 
226 aa  95.5  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 
225 aa  95.1  6e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  32.23 
 
 
238 aa  95.5  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  36.9 
 
 
233 aa  95.1  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.02 
 
 
219 aa  95.1  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  36.9 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  30.59 
 
 
227 aa  94.4  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 
228 aa  93.6  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  34.22 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  31.08 
 
 
223 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 
235 aa  94  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  30.66 
 
 
232 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
235 aa  94  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 
225 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 
225 aa  92.8  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
234 aa  92.8  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  30.37 
 
 
225 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
234 aa  92  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 
272 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  30.52 
 
 
226 aa  91.7  8e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 
272 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  32.02 
 
 
243 aa  91.3  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 
233 aa  90.9  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
227 aa  90.9  1e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  28.7 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 
266 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 
257 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  32.8 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2014  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 
236 aa  90.5  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  32.55 
 
 
222 aa  89.7  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  30.15 
 
 
250 aa  89  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
209 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0118  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.05 
 
 
232 aa  89.4  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
272 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  32.06 
 
 
227 aa  89  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  33.87 
 
 
237 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
237 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  32.63 
 
 
237 aa  89  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2233  phosphoglycolate phosphatase  32.8 
 
 
238 aa  88.6  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.25252  normal  0.513173 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  32.28 
 
 
209 aa  88.6  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 
224 aa  88.2  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
228 aa  88.2  9e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>