More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1395 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  100 
 
 
215 aa  441  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.06 
 
 
219 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  42.4 
 
 
217 aa  196  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  42.59 
 
 
229 aa  189  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  39.63 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.81 
 
 
217 aa  182  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.2 
 
 
220 aa  180  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
224 aa  177  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.63 
 
 
219 aa  175  5e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.19 
 
 
220 aa  167  8e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  40.89 
 
 
220 aa  167  1e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40 
 
 
221 aa  166  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.55 
 
 
220 aa  166  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.09 
 
 
218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.19 
 
 
217 aa  151  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  38.36 
 
 
220 aa  149  4e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  36.24 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.56 
 
 
217 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.36 
 
 
218 aa  143  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.29 
 
 
218 aa  137  8.999999999999999e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.24 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.86 
 
 
218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  33.81 
 
 
223 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.41 
 
 
219 aa  123  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
233 aa  124  2e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  32.69 
 
 
217 aa  121  7e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.58 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.81 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  34.95 
 
 
209 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.77 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.16 
 
 
222 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 
218 aa  109  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 
235 aa  107  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  32.28 
 
 
224 aa  107  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 
226 aa  107  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  32.37 
 
 
209 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 
461 aa  105  7e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  32.37 
 
 
209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  29.72 
 
 
272 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  32.39 
 
 
214 aa  102  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  32.56 
 
 
226 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.08 
 
 
216 aa  102  4e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  31.88 
 
 
209 aa  102  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
226 aa  101  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 
228 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  29.25 
 
 
272 aa  101  8e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
231 aa  101  9e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1983  Phosphoglycolate phosphatase  31.5 
 
 
257 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 
226 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
232 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  29.35 
 
 
230 aa  99.8  3e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
272 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  28.84 
 
 
225 aa  99  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  30.58 
 
 
250 aa  99  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 
272 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 
272 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 
257 aa  96.7  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  30.39 
 
 
218 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  28.3 
 
 
272 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0608  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.69 
 
 
217 aa  96.3  3e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.17264e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  30.16 
 
 
231 aa  95.5  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
248 aa  95.5  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
243 aa  95.1  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1367  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.26 
 
 
209 aa  94  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  30.32 
 
 
225 aa  94.4  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  27.88 
 
 
223 aa  94  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  24.77 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 
229 aa  94.4  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  31.22 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  26.39 
 
 
216 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  28.05 
 
 
235 aa  92.8  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.52 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  30.29 
 
 
229 aa  92.8  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  30.93 
 
 
221 aa  92.4  4e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  26.51 
 
 
225 aa  92  5e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 
227 aa  92.4  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  26.61 
 
 
221 aa  92  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 
223 aa  92  6e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  26.85 
 
 
214 aa  92  7e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
232 aa  91.7  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  26.44 
 
 
226 aa  91.7  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  26.76 
 
 
221 aa  91.7  8e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
225 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1947  HAD family hydrolase  27.23 
 
 
239 aa  91.3  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0571  phosphoglycolate phosphatase  27.16 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 
225 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2305  HAD family hydrolase  25.93 
 
 
234 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000065885 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  27.66 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 
225 aa  90.1  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  27.62 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  27.06 
 
 
225 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  29.11 
 
 
266 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  27.7 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  27.65 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>