More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2097 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  46.08 
 
 
217 aa  203  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.83 
 
 
219 aa  189  2e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  42.86 
 
 
225 aa  188  5.999999999999999e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.74 
 
 
220 aa  185  4e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.4 
 
 
217 aa  184  9e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.72 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  42.13 
 
 
224 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.74 
 
 
219 aa  179  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  41.01 
 
 
229 aa  175  6e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.55 
 
 
220 aa  174  9.999999999999999e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  40.64 
 
 
220 aa  168  5e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  40 
 
 
215 aa  166  2e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.96 
 
 
217 aa  165  4e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.16 
 
 
220 aa  165  5e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.19 
 
 
218 aa  160  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  36.49 
 
 
216 aa  156  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.96 
 
 
217 aa  150  2e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.26 
 
 
217 aa  149  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  34.11 
 
 
218 aa  145  6e-34  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.88 
 
 
218 aa  144  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 
220 aa  141  9e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  36.79 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.89 
 
 
216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1983  Phosphoglycolate phosphatase  36.91 
 
 
257 aa  132  5e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 
224 aa  125  7e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  33.96 
 
 
222 aa  125  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  32.42 
 
 
238 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  32.42 
 
 
227 aa  124  1e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.41 
 
 
216 aa  122  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
272 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  34.92 
 
 
272 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  33.96 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  35.26 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  36.41 
 
 
223 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  32.55 
 
 
226 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.87 
 
 
216 aa  118  7.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  34.4 
 
 
227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  31.78 
 
 
229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  32.23 
 
 
221 aa  116  3e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  34.39 
 
 
266 aa  115  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
272 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00378  phosphoglycolate phosphatase  30.52 
 
 
250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.590108  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  35.91 
 
 
221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
272 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 
229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.17 
 
 
233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.6 
 
 
222 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  31.47 
 
 
218 aa  112  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  31.08 
 
 
257 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0710  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 
218 aa  111  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
227 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  29.3 
 
 
226 aa  111  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  33.16 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  34.29 
 
 
209 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1226  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000334097  normal  0.244171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  32.66 
 
 
226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  33.51 
 
 
216 aa  109  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  33.81 
 
 
209 aa  109  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  34.9 
 
 
219 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
209 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1348  phosphoglycolate phosphatase  29.25 
 
 
233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  33.81 
 
 
209 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  34.36 
 
 
221 aa  108  5e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1630  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 
224 aa  108  7.000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  29.09 
 
 
233 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  29.73 
 
 
230 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.09 
 
 
233 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 
226 aa  107  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1573  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 
229 aa  107  2e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  32.52 
 
 
226 aa  106  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  29.41 
 
 
232 aa  107  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1367  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.52 
 
 
209 aa  106  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 
225 aa  106  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  27.91 
 
 
227 aa  105  5e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
225 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
221 aa  105  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
222 aa  105  5e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
225 aa  105  5e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
225 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1970  HAD family hydrolase  31.73 
 
 
224 aa  105  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000840588  hitchhiker  0.0000283984 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.33 
 
 
219 aa  105  6e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  30.99 
 
 
227 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  30.99 
 
 
227 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
209 aa  105  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 
234 aa  105  7e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.47 
 
 
226 aa  104  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 
225 aa  104  9e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 
223 aa  104  9e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.68 
 
 
217 aa  104  9e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  29.58 
 
 
221 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 
243 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.52 
 
 
225 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.51 
 
 
222 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
225 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  32.65 
 
 
225 aa  103  2e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  28.83 
 
 
225 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  30.26 
 
 
217 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>