More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0401 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 		 209 aa  428  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  43.35 
 
 		 217 aa  142  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  41.08 
 
 		 214 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  36.92 
 
 		 266 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  36.28 
 
 		 226 aa  126  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  35.98 
 
 		 272 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 		 226 aa  125  6e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  37.7 
 
 		 226 aa  124  9e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  34.91 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  37.79 
 
 		 272 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  39.27 
 
 		 257 aa  122  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 		 225 aa  121  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  38.1 
 
 		 226 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  38.46 
 
 		 225 aa  121  8e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.78 
 
 		 222 aa  121  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 		 227 aa  121  9e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.5 
 
 		 222 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  37.95 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 227 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  37.33 
 
 		 272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  34.26 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  36.17 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  36.62 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 		 227 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  36 
 
 		 232 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  38.25 
 
 		 228 aa  118  7e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  35.9 
 
 		 235 aa  118  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  35.51 
 
 		 272 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  38.69 
 
 		 229 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  37.57 
 
 		 272 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  39.46 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  35.87 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  35.87 
 
 		 224 aa  114  8.999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  34 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  38.31 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  35.98 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  35.32 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 225 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  34.83 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  35.78 
 
 		 272 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  35.38 
 
 		 235 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 		 226 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  35.64 
 
 		 272 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 		 221 aa  112  6e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 		 225 aa  111  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 		 227 aa  111  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  34.33 
 
 		 231 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  35.64 
 
 		 272 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  35.78 
 
 		 234 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 		 227 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  35.29 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1857  phosphoglycolate phosphatase  36.02 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  32.7 
 
 		 221 aa  108  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  38.34 
 
 		 234 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1040  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.69 
 
 		 211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  34.8 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.46 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  34.12 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  32.98 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 		 227 aa  106  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  35.15 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  34.22 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  36.11 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.41 
 
 		 221 aa  105  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  32.66 
 
 		 224 aa  104  7e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  34.85 
 
 		 237 aa  104  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  35.64 
 
 		 225 aa  103  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.74 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2304  HAD family hydrolase  31.65 
 
 		 230 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.652895  hitchhiker  0.000448515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  34.87 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  36.11 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 216 aa  103  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  34.22 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1973  phosphoglycolate phosphatase  37.14 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.662433 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  34.05 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  35.42 
 
 		 242 aa  102  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  34.69 
 
 		 232 aa  102  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.96 
 
 		 217 aa  102  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  34.34 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  34.33 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 		 227 aa  101  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  35 
 
 		 209 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  34.57 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  33.86 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  32.83 
 
 		 250 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>