More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0976 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  59.09 
 
 
220 aa  277  8e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  57.14 
 
 
229 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  55 
 
 
219 aa  250  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  52.38 
 
 
219 aa  231  6e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  53.33 
 
 
220 aa  229  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  46.54 
 
 
220 aa  206  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  46.08 
 
 
217 aa  202  4e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.12 
 
 
217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.86 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  39.63 
 
 
215 aa  188  7e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  43.84 
 
 
224 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.52 
 
 
218 aa  176  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.78 
 
 
217 aa  170  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.06 
 
 
218 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.33 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  38.36 
 
 
220 aa  160  2e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  36.15 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.86 
 
 
218 aa  149  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.41 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  36.79 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  39.15 
 
 
218 aa  145  5e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  38.5 
 
 
217 aa  139  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.1 
 
 
216 aa  124  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.33 
 
 
216 aa  123  2e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1983  Phosphoglycolate phosphatase  39.69 
 
 
257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.8 
 
 
216 aa  118  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.35 
 
 
233 aa  118  7.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.18 
 
 
222 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 
218 aa  116  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  34.6 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1220  phosphoglycolate phosphatase  32.88 
 
 
225 aa  112  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  34.9 
 
 
229 aa  112  3e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  35.19 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  31.51 
 
 
223 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 
222 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 
224 aa  111  9e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  31.05 
 
 
226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  32.26 
 
 
226 aa  108  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  33.5 
 
 
272 aa  108  6e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  31.12 
 
 
225 aa  107  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  31.77 
 
 
272 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  31.5 
 
 
272 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  31.77 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  31.77 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  31 
 
 
272 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 
235 aa  102  4e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2111  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
228 aa  102  4e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  32.3 
 
 
226 aa  101  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  32.34 
 
 
225 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  29.55 
 
 
223 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  29.55 
 
 
223 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  35.65 
 
 
232 aa  101  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  31.39 
 
 
223 aa  101  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  31.66 
 
 
225 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15750  phosphoglycolate phosphatase  29.68 
 
 
223 aa  99  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  32.57 
 
 
461 aa  98.6  6e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  31 
 
 
266 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.26 
 
 
219 aa  98.6  7e-20  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 
217 aa  98.2  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  33.7 
 
 
221 aa  98.2  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 
257 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  34.18 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  31.5 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 
209 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
228 aa  96.7  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  30.5 
 
 
272 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 
209 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  30.57 
 
 
223 aa  95.5  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  28.95 
 
 
221 aa  95.5  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 
230 aa  95.1  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  29.29 
 
 
235 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  32.83 
 
 
214 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  29.81 
 
 
238 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 
233 aa  94.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 
209 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  31.03 
 
 
227 aa  94  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
272 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  29.84 
 
 
209 aa  94  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 
221 aa  94  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 
227 aa  93.6  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1371  phosphoglycolate phosphatase  28.18 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  31.36 
 
 
227 aa  93.2  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
238 aa  92.8  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 
248 aa  92.4  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1189  HAD family hydrolase  30 
 
 
219 aa  92.4  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  31.09 
 
 
231 aa  92  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  26.82 
 
 
227 aa  92  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.77 
 
 
227 aa  92  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 
238 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4023  phosphoglycolate phosphatase  32.87 
 
 
227 aa  92  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 
227 aa  91.7  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 
240 aa  91.7  9e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  30.26 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  30.18 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>