273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0796 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  100 
 
 
231 aa  473  1e-133  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.84 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  29.35 
 
 
211 aa  64.7  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  35.58 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  25.26 
 
 
241 aa  64.3  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  24.89 
 
 
221 aa  64.3  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.58 
 
 
251 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.88 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
224 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  22.33 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  22.96 
 
 
225 aa  59.7  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  31.19 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.36 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  32.09 
 
 
225 aa  58.2  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  31.09 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30.28 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  30.28 
 
 
224 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  30.28 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  31.09 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.04 
 
 
222 aa  57.4  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2884  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.89 
 
 
202 aa  57  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  30.28 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  36.19 
 
 
245 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  34.68 
 
 
258 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  30.28 
 
 
223 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  35.79 
 
 
218 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  34.83 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.16 
 
 
250 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0025  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  31.45 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.64 
 
 
234 aa  55.5  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0647  HAD family hydrolase  27.46 
 
 
221 aa  55.5  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.496334  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0220  HAD family hydrolase  35.2 
 
 
238 aa  55.1  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.208784 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.96 
 
 
238 aa  55.1  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  26.58 
 
 
217 aa  55.1  0.0000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  31.58 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  31.58 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  31.58 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  31.58 
 
 
225 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  30.7 
 
 
228 aa  54.7  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  31.58 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.58 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.68 
 
 
228 aa  54.3  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  29.71 
 
 
235 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  29.37 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5968  HAD family hydrolase  33.06 
 
 
213 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321367  normal  0.104551 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  31.58 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  31.58 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5456  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40 
 
 
217 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  0.179199 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  34.85 
 
 
219 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  28.42 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  31.58 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.33 
 
 
583 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  22.7 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.25 
 
 
227 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.153215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  32.59 
 
 
216 aa  52.8  0.000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  30.56 
 
 
198 aa  52.8  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  32.63 
 
 
217 aa  52.4  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  30.09 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.95 
 
 
248 aa  52.4  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  30.09 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.96 
 
 
254 aa  52.8  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  30.09 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  30.09 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  30.09 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.08 
 
 
250 aa  52.4  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  29.85 
 
 
224 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1281  HAD superfamily hydrolase  32.04 
 
 
231 aa  52  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  27.59 
 
 
219 aa  52  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.55 
 
 
234 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  34.15 
 
 
255 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2373  HAD family hydrolase  34.91 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605014 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.12 
 
 
230 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.77 
 
 
228 aa  50.8  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18080  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  26.53 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.386622 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0492  hydrolase  31.54 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.3 
 
 
219 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  34.29 
 
 
243 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.7 
 
 
229 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  25.22 
 
 
222 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3991  HAD family hydrolase  27.46 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0589691  normal  0.286342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  25.36 
 
 
224 aa  50.4  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  24.89 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  29.17 
 
 
128 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2997  HAD family hydrolase  34.38 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.155804 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.35 
 
 
216 aa  49.7  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.16 
 
 
219 aa  49.3  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.81 
 
 
268 aa  49.3  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  28.32 
 
 
231 aa  49.3  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0649  hydrolase  30.61 
 
 
211 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2352  HAD family hydrolase  26.27 
 
 
222 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.00492029  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.51 
 
 
217 aa  48.9  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0521  hypothetical protein  25.37 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  24.52 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  24.52 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  24.52 
 
 
230 aa  48.5  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.45 
 
 
260 aa  48.5  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  24.8 
 
 
225 aa  48.5  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3370  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.01 
 
 
236 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.013018  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29 
 
 
220 aa  47.8  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>