More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1413 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  100 
 
 		 255 aa  514  1.0000000000000001e-145  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  80.4 
 
 		 258 aa  417  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  27.19 
 
 		 223 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3336  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.31 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.424604  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.78 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  27.31 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  29.17 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  26.61 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.75 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  26.75 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.21 
 
 		 260 aa  79.3  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  36.57 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.62 
 
 		 222 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  27.31 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  30.21 
 
 		 248 aa  74.7  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  42.45 
 
 		 220 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  25.12 
 
 		 234 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  40.8 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  29.61 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  35.82 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0720  HAD family hydrolase  29.18 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.070073 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  25 
 
 		 239 aa  69.3  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  27.05 
 
 		 242 aa  69.3  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  31.37 
 
 		 224 aa  68.9  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1176  HAD family hydrolase  42.39 
 
 		 337 aa  68.6  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00246579  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  23.11 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  36.21 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  23.11 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  34.31 
 
 		 211 aa  68.2  0.0000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5842  haloacid dehalogenase, type II  26.91 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.59 
 
 		 267 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.470788 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1147  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.58 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.29444  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  28.12 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  28.05 
 
 		 231 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.64 
 
 		 248 aa  67  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.31 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1799  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  35.06 
 
 		 259 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  34.74 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2189  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.71 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  34.5 
 
 		 228 aa  65.5  0.0000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3196  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.345642  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  27.01 
 
 		 227 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  32.84 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  29.73 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0159  hydrolase  36.89 
 
 		 259 aa  65.1  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.971572  normal  0.683122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3802  haloacid dehalogenase, type II  29.41 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.303335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  42.86 
 
 		 219 aa  64.3  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  31.34 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2743  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994994  normal  0.0511558 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.33 
 
 		 583 aa  63.5  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1444  HAD superfamily hydrolase  35.58 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000160322  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  37.84 
 
 		 228 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  34.15 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1937  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.58 
 
 		 231 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.612743  normal  0.0123866 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.79 
 
 		 543 aa  62.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  30.56 
 
 		 248 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  27.31 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  28.07 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.55 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0754  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.67 
 
 		 223 aa  62  0.000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  27.52 
 
 		 231 aa  62  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.79 
 
 		 349 aa  62  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0922  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.87 
 
 		 219 aa  62  0.000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.04 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5571  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  32.86 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3178  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.21 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00001464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.09 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  32.09 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  38.57 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3213  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.09 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  30.6 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  22.67 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.05 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  36.36 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  30.65 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.26 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.07 
 
 		 234 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  28.37 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.63 
 
 		 235 aa  59.7  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0263  HAD family hydrolase  34.96 
 
 		 233 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0241  HAD family hydrolase  31.34 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.155059  normal  0.796884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0804  nucleotidase  30.2 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.82 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5231  HAD superfamily hydrolase  30.6 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  31.5 
 
 		 256 aa  58.9  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0737  HAD family hydrolase  35.83 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421268  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  35.58 
 
 		 222 aa  58.9  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0751  HAD family hydrolase  35.83 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.170461 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0731  HAD family hydrolase  35.83 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  0.481509 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 252 aa  58.5  0.00000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5140  HAD family hydrolase  30.6 
 
 		 231 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  27.89 
 
 		 234 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  24.66 
 
 		 242 aa  58.5  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  32.11 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  29.25 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 252 aa  58.2  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>