More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2928 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  100 
 
 		 230 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2549  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.33 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  28.97 
 
 		 234 aa  76.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  34.33 
 
 		 236 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  25.85 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  44.09 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.04 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  39.22 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  27.82 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  40 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  30.69 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  30 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  41.27 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1018  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.63 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.56631  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  37.84 
 
 		 233 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  40.24 
 
 		 217 aa  63.5  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  25.77 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.11 
 
 		 229 aa  62.4  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  33.96 
 
 		 231 aa  62  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  29.7 
 
 		 255 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3585  HAD family hydrolase  28.75 
 
 		 237 aa  61.6  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0700398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  29.03 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  29.03 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  31.53 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  38.82 
 
 		 228 aa  60.8  0.00000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.23 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  29.7 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  33.88 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  31.48 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  29.7 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  33.73 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  26.55 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.26 
 
 		 229 aa  60.1  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.74 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  42.11 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  27.75 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.2 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.481265  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  29.7 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  29.7 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  32.08 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.83 
 
 		 250 aa  58.9  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1639  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  27.36 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal  0.175401 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.51 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  34.12 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.75 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  33.65 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  33.65 
 
 		 233 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  28.71 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  35.16 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69720  putative hydrolase  42.86 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.673064  normal  0.5613 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6024  putative hydrolase  37.84 
 
 		 232 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  32.93 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  26.87 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  31.78 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  30.58 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  30.58 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  30.58 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.58 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  30.58 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  34.43 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  30.58 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2075  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5502  HAD family hydrolase  35.29 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.178539  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  30.58 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  37.7 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  33.01 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0796  HAD family hydrolase  34.83 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  30.58 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  29.06 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0186  HAD family hydrolase  42.22 
 
 		 230 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  30.56 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0900  HAD family hydrolase  29.7 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  33.85 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  23.46 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2014  HAD family hydrolase  29.37 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2972  HAD family hydrolase  33.68 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0648694 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0221  HAD-superfamily hydrolase  42.7 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3521  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.11 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0899798  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  35.37 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  28.36 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  30.54 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  32.93 
 
 		 234 aa  55.1  0.0000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  29.75 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  29.75 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  29.75 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  29.75 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  29.75 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  30.33 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  29.75 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.83 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.423986  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2328  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  32.14 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.139585  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  27.86 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4086  HAD family hydrolase  35.87 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00479473 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  25.66 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.81 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  27 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3970  HAD family hydrolase  35.87 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  26.6 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3992  HAD family hydrolase  35.87 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.24 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>