More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_0157 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 250 aa  520  1e-147  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4967  nucleotidase  31.77 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.081412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4915  nucleotidase  31.77 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.366204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4812  nucleotidase  31.77 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.622374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4973  nucleotidase  31.77 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.100904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4880  nucleotidase  31.77 
 
 		 225 aa  82.8  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00926428  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  40.37 
 
 		 220 aa  82  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  31.25 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3625  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.25 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.175354  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5886  nucleotidase  31.25 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.252509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4921  nucleotidase  31.25 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4970  nucleotidase  30.73 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000601052  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3683  nucleotidase  31.25 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.847444  hitchhiker  0.000163133 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04215  hypothetical protein  31.25 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.375532  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4608  nucleotidase  30.73 
 
 		 225 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000431721  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  32.29 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4917  nucleotidase  30.73 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000116377  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  32.82 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  26.8 
 
 		 231 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000783  5'-nucleotidase yjjG  27.98 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  26.8 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  27.41 
 
 		 229 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  36.28 
 
 		 219 aa  73.9  0.000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  25.26 
 
 		 231 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06682  nucleotidase  26.94 
 
 		 224 aa  72.8  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  24.21 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0285  nucleotidase  29.69 
 
 		 229 aa  72  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.17 
 
 		 222 aa  72  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  24.39 
 
 		 231 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.47 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2782  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  24.21 
 
 		 230 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195747  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  25.26 
 
 		 231 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0550  nucleotidase  29.53 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2564  2-haloalkanoic acid dehalogenase  28.46 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00980265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2426  HAD family hydrolase  28.1 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0509966  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1990  HAD family hydrolase  36.67 
 
 		 234 aa  66.6  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.169915  normal  0.0795934 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2738  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  28.46 
 
 		 230 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.16 
 
 		 220 aa  65.9  0.0000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0363  nucleotidase  28.12 
 
 		 225 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0192127  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.12 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  39.29 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  28.79 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  27.51 
 
 		 221 aa  65.1  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4039  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25 
 
 		 229 aa  64.3  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.36954 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3797  nucleotidase  28.88 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000341898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  28.16 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1853  nucleotidase  27.84 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0846682  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  28.43 
 
 		 216 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2232  nucleotidase  28.44 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.632327  hitchhiker  0.00198907 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.78 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0372  nucleotidase  28.21 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3606  nucleotidase  28.49 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0341  nucleotidase  28.49 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.6 
 
 		 254 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2289  nucleotidase  27.08 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0240  HAD superfamily hydrolase  31.96 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1948  nucleotidase  27.08 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103765  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2246  nucleotidase  26.98 
 
 		 224 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.75616 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0779  nucleotidase  29.02 
 
 		 228 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.655006  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1837  nucleotidase  27.08 
 
 		 224 aa  61.2  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1941  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.89 
 
 		 230 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  40.51 
 
 		 217 aa  60.8  0.00000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3606  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.71 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00240  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.97 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.5 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1705  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.7 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.495652  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  36.36 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  33.66 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  28.33 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3620  nucleotidase  28.35 
 
 		 227 aa  60.1  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  26.75 
 
 		 233 aa  59.7  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  30.16 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  34.41 
 
 		 234 aa  59.3  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  32.73 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2354  nucleotidase  28.57 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00177475  hitchhiker  0.000000845361 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  32.35 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0375  nucleotidase  28.35 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.272334 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2928  HAD family hydrolase  34.83 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.244628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0261  HAD family hydrolase  25.96 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0362  nucleotidase  28.22 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0412  HAD family hydrolase  27.45 
 
 		 228 aa  58.5  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.251676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0396  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.5 
 
 		 223 aa  58.5  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0253  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 234 aa  58.5  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.334079  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0364  nucleotidase  27.86 
 
 		 245 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0372  nucleotidase  27.84 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000751956  hitchhiker  0.0000283623 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4881  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3999  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815808  hitchhiker  0.00000000000557769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0368  nucleotidase  27.08 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  32.67 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  32.67 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  34.75 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.87 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00341069  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  34.13 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  24.64 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  33.33 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>