147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4488 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4488  HAD family hydrolase  100 
 
 
219 aa  444  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1142  HAD family hydrolase  80.18 
 
 
218 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2725  HAD-superfamily hydrolase  74.88 
 
 
224 aa  338  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.305002  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6763  HAD family hydrolase  76.7 
 
 
216 aa  333  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3651  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  73.02 
 
 
219 aa  320  9.999999999999999e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0310  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  67.43 
 
 
222 aa  289  2e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1941  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  63.24 
 
 
230 aa  249  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139802  normal  0.193956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  55.56 
 
 
220 aa  241  6e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2155  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  52.25 
 
 
235 aa  217  7.999999999999999e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1995  HAD family hydrolase  55.14 
 
 
215 aa  209  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.273033 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2329  HAD-superfamily hydrolase  54.26 
 
 
217 aa  190  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.480139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6883  phosphoglycolate phosphatase  52.66 
 
 
219 aa  188  5.999999999999999e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0577  HAD family hydrolase  49.06 
 
 
216 aa  182  3e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0396  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  46.91 
 
 
223 aa  167  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1637  hydrolase, HAD-superfamily, subfamily IIIA  42.93 
 
 
222 aa  151  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0204902  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3204  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  47.42 
 
 
215 aa  137  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.78222  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  35.61 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  34.85 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  35.11 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  34.09 
 
 
225 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
231 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.29 
 
 
250 aa  66.2  0.0000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.335039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4905  hypothetical protein  24.73 
 
 
224 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  31.54 
 
 
234 aa  58.5  0.00000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4926  hypothetical protein  24.55 
 
 
224 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0332  hypothetical protein  23.35 
 
 
223 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4520  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.11 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4539  HAD superfamily hydrolase  24.37 
 
 
224 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  31.96 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  31.96 
 
 
239 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  31.68 
 
 
215 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4618  HAD family hydrolase  21.83 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4906  hypothetical protein  22.84 
 
 
223 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.792086  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4940  L-2-haloalkanoic acid dehalogenase  23.21 
 
 
224 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_474  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.77 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.81 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  25.19 
 
 
242 aa  53.9  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.31 
 
 
237 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1751  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.3 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000165887  normal  0.0449788 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  29.92 
 
 
234 aa  53.1  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0172  HAD family hydrolase  30.15 
 
 
233 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00286401  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2677  HAD family hydrolase  26.7 
 
 
222 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.73 
 
 
226 aa  51.6  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0709  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.16 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0854656 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21780  predicted HAD superfamily hydrolase  38.78 
 
 
244 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000727615  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0682  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  28.16 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0732  HAD family hydrolase  31.06 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.447579  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4681  HAD superfamily hydrolase  33.68 
 
 
128 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  32.95 
 
 
243 aa  50.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 2 (HAD-like)  33.08 
 
 
236 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177133  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4225  HAD family hydrolase  31.73 
 
 
247 aa  50.1  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  26.24 
 
 
228 aa  49.7  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_7222  predicted protein  35.23 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.74166  normal  0.591423 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.09 
 
 
263 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0133  HAD family hydrolase  26.56 
 
 
231 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1515  HAD family hydrolase  38.1 
 
 
229 aa  48.5  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000770474 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5332  phosphatase  27.57 
 
 
199 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.284807 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  27.69 
 
 
231 aa  48.1  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.33 
 
 
238 aa  47.8  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3623  HAD superfamily hydrolase  22.69 
 
 
225 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.95626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1687  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30 
 
 
248 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0106556 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  34.04 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1167  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0557  haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  25.95 
 
 
235 aa  47  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.262309  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2509  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
217 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.0142502 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.46 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  34.02 
 
 
228 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1946  hypothetical protein  40 
 
 
70 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.185313  normal  0.213914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4662  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
239 aa  47.4  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4270  phosphatase  27.57 
 
 
199 aa  47  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4363  phosphatase  27.57 
 
 
199 aa  47  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3930  hydrolase, HAD superfamily  25.48 
 
 
207 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3660  hydrolase  29.41 
 
 
234 aa  46.6  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.150551 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  29.55 
 
 
211 aa  46.2  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1592  HAD family hydrolase  44 
 
 
266 aa  45.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03770  phosphatase  26.49 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.943463  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.49 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.43 
 
 
227 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4110  phosphatase  26.49 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0806852  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4408  phosphatase  26.49 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4133  phosphatase  26.49 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03719  hypothetical protein  26.49 
 
 
199 aa  45.4  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.77682  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1053  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.41 
 
 
246 aa  45.4  0.0007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47740  haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  28.79 
 
 
233 aa  45.4  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127906  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  28.57 
 
 
221 aa  45.1  0.0008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  29.08 
 
 
234 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0809  HAD family hydrolase  25.74 
 
 
218 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1747  HAD family hydrolase  36.67 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.461787  normal  0.255777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53790  putative haloacid dehalogenase  26.32 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0417823  normal  0.160959 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  22.43 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  28.81 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3076  haloacid dehalogenase, type II  25.81 
 
 
222 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.325945  normal  0.0389306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4708  putative haloacid dehalogenase  26.32 
 
 
233 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.98 
 
 
231 aa  44.7  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  28.81 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  27.4 
 
 
237 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  29.1 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4292  HAD family hydrolase  24.84 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4818  REG-2-like HAD superfamily hydrolase  27.72 
 
 
217 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.153483  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1397  hypothetical protein  35.21 
 
 
158 aa  43.5  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.729553 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>