More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0952 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0952  HAD family hydrolase  100 
 
 
242 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2292  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  35.38 
 
 
228 aa  75.9  0.0000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.138759  normal  0.0114246 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0021  HAD family hydrolase  27.45 
 
 
233 aa  75.5  0.0000000000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2832  HAD family hydrolase  32 
 
 
248 aa  75.1  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.106168  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1068  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.92 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00420484  normal  0.997021 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1054  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.7 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.149567 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0889  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.78 
 
 
221 aa  67.8  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.68663  normal  0.226344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  34.07 
 
 
219 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2297  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
248 aa  65.9  0.0000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.229995  normal  0.0190476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1413  HAD family hydrolase  27.05 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  26.03 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 
226 aa  62.8  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 
223 aa  62.8  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2631  HAD family hydrolase  27.36 
 
 
235 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0101  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.42 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00251058  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  33.08 
 
 
233 aa  62  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  34.51 
 
 
235 aa  61.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  25.15 
 
 
225 aa  60.8  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 
227 aa  60.1  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.78 
 
 
218 aa  60.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  30 
 
 
231 aa  59.3  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  31.54 
 
 
233 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  31.65 
 
 
222 aa  58.9  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  23.36 
 
 
234 aa  57.8  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1436  hypothetical protein  29.91 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0136141  normal  0.0979488 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  30.53 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0129  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.86 
 
 
543 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  30.53 
 
 
239 aa  57.8  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.03 
 
 
248 aa  57  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  30.33 
 
 
224 aa  57.4  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  31.3 
 
 
257 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0422  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 
228 aa  57  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 
272 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05620  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase protein  23.67 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1762  HAD superfamily hydrolase  25.73 
 
 
239 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0794121  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  29.37 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  28.1 
 
 
218 aa  56.2  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2451  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39 
 
 
212 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2094  hydrolase  34.13 
 
 
283 aa  55.8  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1518  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.69 
 
 
216 aa  55.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.801994 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  35.11 
 
 
220 aa  55.5  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0642  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.18 
 
 
206 aa  55.1  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0688411  normal  0.579758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  26.83 
 
 
272 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  30.53 
 
 
242 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.68 
 
 
238 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1551  HAD family hydrolase  26.34 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  26.12 
 
 
227 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1707  haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.7 
 
 
242 aa  54.7  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.520366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  31.67 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  25.42 
 
 
230 aa  55.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4115  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.9 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00317051 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0533  nucleotidase  31.01 
 
 
225 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.330887  normal  0.0227178 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0412  HAD family hydrolase  29.84 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4436  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.39 
 
 
216 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00258568  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  28.15 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0412  putative phosphatase  33.7 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  29.84 
 
 
228 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28840  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  42.65 
 
 
583 aa  53.9  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.107829  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1476  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.29 
 
 
254 aa  53.5  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2067  HAD family hydrolase  33.7 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0859939  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2336  HAD family hydrolase  36.9 
 
 
231 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.509915  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2236  haloacid dehalogenase, type II  29.17 
 
 
222 aa  53.1  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.765842  normal  0.282262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5409  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.78 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.470788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  29.23 
 
 
216 aa  52.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  28.15 
 
 
272 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2117  HAD family hydrolase  40.68 
 
 
210 aa  52.8  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  31.48 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 
252 aa  52.8  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  29.23 
 
 
216 aa  52.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  24.02 
 
 
212 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1323  HAD family hydrolase  25.82 
 
 
269 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00954891  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  30.83 
 
 
216 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  32.04 
 
 
215 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07310  putative hydrolase  34.91 
 
 
224 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.642028  normal  0.985429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1844  phosphoglycolate phosphatase  26.77 
 
 
223 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203973  normal  0.771348 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  29.55 
 
 
208 aa  52.4  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  30.83 
 
 
216 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  30.83 
 
 
216 aa  52.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  30.83 
 
 
216 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  30.83 
 
 
216 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.24 
 
 
222 aa  52.4  0.000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  27.95 
 
 
214 aa  52  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  26.89 
 
 
225 aa  52  0.000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  28.43 
 
 
203 aa  52  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  30.83 
 
 
216 aa  52  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  31.07 
 
 
205 aa  52  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04249  nucleotidase  30.3 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.306947  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0614  HAD family hydrolase  24.02 
 
 
212 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.631998 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  31.4 
 
 
228 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>