More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2894 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  100 
 
 
243 aa  498  1e-140  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  45.62 
 
 
221 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  43.93 
 
 
213 aa  195  7e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.05 
 
 
235 aa  181  6e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  41.28 
 
 
241 aa  178  8e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  37.73 
 
 
231 aa  159  5e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0472  HAD family hydrolase  38.36 
 
 
261 aa  157  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.523945  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  42.57 
 
 
228 aa  156  3e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  30.05 
 
 
211 aa  97.1  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  27.11 
 
 
231 aa  91.3  1e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  30.24 
 
 
226 aa  90.5  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2785  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.02 
 
 
235 aa  85.5  6e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  28.32 
 
 
225 aa  85.5  6e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  30.15 
 
 
248 aa  84.7  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  39.39 
 
 
226 aa  82.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  28.07 
 
 
214 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
272 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  28.3 
 
 
272 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  29.33 
 
 
224 aa  79.7  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0027  HAD superfamily hydrolase  28 
 
 
235 aa  79.7  0.00000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  28.08 
 
 
227 aa  79  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  27.83 
 
 
272 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  36.62 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  27.23 
 
 
272 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.09 
 
 
207 aa  76.3  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.98 
 
 
219 aa  75.5  0.0000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  25.85 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  29.79 
 
 
227 aa  75.5  0.0000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.67 
 
 
237 aa  75.5  0.0000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.7 
 
 
234 aa  75.5  0.0000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.42 
 
 
222 aa  75.1  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
237 aa  75.1  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 
228 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 
272 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  26.75 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.69 
 
 
218 aa  72.8  0.000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  29.06 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 
221 aa  72.4  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001976  2-haloalkanoic acid dehalogenase  25.21 
 
 
241 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000579937  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  27.39 
 
 
222 aa  72  0.000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 
272 aa  72  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0704  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.57 
 
 
231 aa  72  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.463246  normal  0.864545 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  27.75 
 
 
232 aa  71.2  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.79 
 
 
268 aa  71.6  0.00000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  27.19 
 
 
225 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  29.47 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  28.14 
 
 
238 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  25.65 
 
 
223 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  24.78 
 
 
225 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  33.59 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2534  HAD superfamily hydrolase  28.64 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0986265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2112  HAD family hydrolase  31.79 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2720  HAD superfamily hydrolase  28.64 
 
 
230 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  27.35 
 
 
222 aa  70.5  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 
228 aa  70.1  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2747  HAD superfamily hydrolase  28.57 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00479401  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 
229 aa  70.1  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  26.13 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 
225 aa  69.7  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  26.01 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4215  HAD family hydrolase  27.5 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.842339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  34.51 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  27.23 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2458  HAD superfamily hydrolase  28.17 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536577  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  34.62 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  29.58 
 
 
300 aa  68.9  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 
226 aa  68.9  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  24.75 
 
 
242 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  27.03 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2494  HAD superfamily hydrolase  27.7 
 
 
231 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000287122  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  27.81 
 
 
228 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  26.8 
 
 
234 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02868  hydrolase  25.75 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  25.62 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.77 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2172  HAD family hydrolase  29.74 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  27.52 
 
 
237 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.83 
 
 
349 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  26.58 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4527  phosphoglycolate phosphatase  27.27 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27 
 
 
227 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  26.58 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 
245 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  26.53 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  29.07 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  29.02 
 
 
225 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  26.34 
 
 
251 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  29.13 
 
 
226 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  27.35 
 
 
218 aa  67.8  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>