More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0992 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 
235 aa  477  1e-134  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  46.34 
 
 
213 aa  174  7e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  44.65 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0472  HAD family hydrolase  43.66 
 
 
261 aa  172  5e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.523945  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  43.05 
 
 
243 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  38.71 
 
 
221 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  40.19 
 
 
228 aa  142  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  34.74 
 
 
231 aa  118  7e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  32.8 
 
 
211 aa  102  5e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  26.75 
 
 
225 aa  85.1  8e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  26.07 
 
 
225 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  26.21 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0064  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.05 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  27.37 
 
 
231 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  25.73 
 
 
225 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  28.05 
 
 
227 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2038  HAD superfamily hydrolase  29.19 
 
 
228 aa  70.5  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3116  HAD family hydrolase  37.17 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.553412  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  31.58 
 
 
248 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  34.25 
 
 
237 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2262  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.05 
 
 
248 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000545934 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  28.17 
 
 
240 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  28.51 
 
 
233 aa  63.5  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3977  HAD family hydrolase  28.92 
 
 
258 aa  63.2  0.000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.883947 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.27 
 
 
234 aa  63.2  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  25.16 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  25.16 
 
 
239 aa  62.4  0.000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  29.57 
 
 
222 aa  62.4  0.000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0268  HAD superfamily hydrolase  25.16 
 
 
242 aa  62  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 
227 aa  62  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 
226 aa  61.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1388  haloacid dehalogenase  27.36 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  28.7 
 
 
221 aa  61.2  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0482  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.09 
 
 
215 aa  61.6  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1991  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.61 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  25.42 
 
 
227 aa  60.5  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0754  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.23 
 
 
223 aa  60.8  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.531988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.89 
 
 
218 aa  60.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0736  HAD superfamily hydrolase  23.33 
 
 
300 aa  60.8  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  27.64 
 
 
218 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2828  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.51 
 
 
231 aa  60.1  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1679  HAD family hydrolase  26.4 
 
 
245 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5662  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.62 
 
 
349 aa  60.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.342758 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  26.27 
 
 
243 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4069  HAD family hydrolase  23.28 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.256512  normal  0.511576 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2746  HAD family hydrolase  35 
 
 
226 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.20923  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
254 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
254 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  24.68 
 
 
225 aa  59.3  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  28.87 
 
 
253 aa  59.3  0.00000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0751  HAD superfamily hydrolase  21.93 
 
 
300 aa  58.9  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0322  HAD family hydrolase  27.31 
 
 
234 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
218 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  25.7 
 
 
209 aa  58.5  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  25 
 
 
227 aa  58.5  0.00000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  30.05 
 
 
251 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  25.85 
 
 
248 aa  57.8  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0509  HAD family hydrolase  22.28 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1882  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.95 
 
 
248 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0746136  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1203  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.11 
 
 
241 aa  58.2  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.481265  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  31.5 
 
 
237 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.73 
 
 
268 aa  58.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.83 
 
 
222 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3072  HAD family hydrolase  23.68 
 
 
236 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.302299  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0533  HAD family hydrolase  22.28 
 
 
234 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.298334  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  29.75 
 
 
228 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  28.22 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2227  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  30.95 
 
 
208 aa  57.4  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.672436  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  28.11 
 
 
220 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  28.22 
 
 
238 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  26.44 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  25.11 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  26.27 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2525  HAD family hydrolase  26.57 
 
 
245 aa  57.4  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0221998  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  31.75 
 
 
257 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3108  REG-2-like, HAD superfamily (subfamily IA) hydrolase  34.04 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  24.67 
 
 
263 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
222 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26.91 
 
 
272 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  32.81 
 
 
215 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.89 
 
 
237 aa  56.2  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.845236  normal  0.047743 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  25.53 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3367  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  23.25 
 
 
236 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3145  HAD superfamily hydrolase  23.25 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3039  HAD superfamily hydrolase  23.25 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0500536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3392  HAD superfamily hydrolase  23.25 
 
 
236 aa  55.8  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 
257 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3132  HAD superfamily hydrolase  23.25 
 
 
236 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  25.45 
 
 
214 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  26.7 
 
 
272 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1554  putative phosphatase  24.79 
 
 
218 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  29.82 
 
 
222 aa  55.5  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1446  putative phosphatase  24.79 
 
 
218 aa  55.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2904  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
238 aa  55.5  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  29.93 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.56 
 
 
227 aa  55.1  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>