More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1697 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  100 
 
 
231 aa  470  1e-132  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  50 
 
 
230 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  35.51 
 
 
217 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  35.94 
 
 
230 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  35.21 
 
 
230 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  35.27 
 
 
220 aa  117  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  32.88 
 
 
216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  34.1 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
209 aa  110  3e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  33.01 
 
 
216 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  34.15 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  33.64 
 
 
216 aa  108  8.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  32.88 
 
 
218 aa  108  9.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 
232 aa  107  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  30.04 
 
 
235 aa  107  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.64 
 
 
228 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  33.48 
 
 
231 aa  106  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  29.63 
 
 
222 aa  106  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  34.93 
 
 
234 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  31.86 
 
 
223 aa  105  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  29.86 
 
 
227 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  32.16 
 
 
220 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1640  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
220 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  31.34 
 
 
232 aa  104  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  31.67 
 
 
224 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  32.71 
 
 
214 aa  102  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  32.13 
 
 
224 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  32.13 
 
 
224 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
226 aa  101  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  31.86 
 
 
215 aa  101  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  29.26 
 
 
228 aa  101  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  30.8 
 
 
228 aa  100  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  30.18 
 
 
227 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 
250 aa  101  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.91 
 
 
236 aa  100  2e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  31.05 
 
 
222 aa  100  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.09 
 
 
219 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.64 
 
 
219 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  33.95 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  31.8 
 
 
215 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.93 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.61 
 
 
209 aa  99.4  4e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  30.84 
 
 
227 aa  99  5e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  34.88 
 
 
231 aa  98.6  8e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  28.76 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  32.73 
 
 
219 aa  98.2  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  30.63 
 
 
226 aa  98.2  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.03 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 
225 aa  96.7  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  31.34 
 
 
227 aa  95.9  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
224 aa  95.9  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  32.27 
 
 
229 aa  95.9  5e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  33.5 
 
 
219 aa  95.1  8e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 
227 aa  95.1  9e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
227 aa  95.1  9e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  28.44 
 
 
226 aa  94.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  27.48 
 
 
225 aa  93.6  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 
227 aa  94  2e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  28.89 
 
 
227 aa  94  2e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  29.28 
 
 
231 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.66 
 
 
216 aa  92  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  29.58 
 
 
219 aa  92.4  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  28.83 
 
 
272 aa  92  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  31.72 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
225 aa  91.3  1e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  32.16 
 
 
246 aa  91.7  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  31.72 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  27.59 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  30.7 
 
 
222 aa  91.7  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4164  HAD family hydrolase  33.52 
 
 
193 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0540485  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  27.59 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  31.65 
 
 
219 aa  90.9  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  31.72 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  28.24 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  28.24 
 
 
216 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  29.09 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0993  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  28.24 
 
 
216 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  28.24 
 
 
216 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  32.34 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  27.31 
 
 
215 aa  90.1  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  35.57 
 
 
234 aa  90.1  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  31.65 
 
 
219 aa  90.9  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  32.7 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0989  HAD family hydrolase  31.82 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
233 aa  90.5  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  28.83 
 
 
272 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  34 
 
 
227 aa  89.7  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  28.24 
 
 
216 aa  90.1  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
219 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  31.84 
 
 
229 aa  90.1  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  27.78 
 
 
216 aa  89.4  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  32.76 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
252 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  29.68 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>