More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_14830 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  100 
 
 
219 aa  447  1e-125  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2463  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50.5 
 
 
217 aa  191  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35707  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  44.19 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  34.91 
 
 
210 aa  150  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  39.91 
 
 
225 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  40.38 
 
 
225 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  39.81 
 
 
209 aa  147  1.0000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.97 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  35.05 
 
 
214 aa  141  8e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  34.58 
 
 
214 aa  141  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  33.02 
 
 
215 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  33.03 
 
 
222 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.86 
 
 
296 aa  132  3.9999999999999996e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  34.43 
 
 
217 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  32.87 
 
 
212 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  31.63 
 
 
215 aa  132  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  32.42 
 
 
216 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  32.42 
 
 
216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  34.58 
 
 
222 aa  129  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  31.96 
 
 
216 aa  129  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  31.96 
 
 
216 aa  129  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  31.96 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  31.96 
 
 
216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  31.96 
 
 
216 aa  128  6e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  31.96 
 
 
216 aa  128  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.18 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0912057  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  31.51 
 
 
216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.93 
 
 
209 aa  126  3e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.99 
 
 
218 aa  118  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2037  HAD family hydrolase  39.68 
 
 
225 aa  116  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00546936 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.71 
 
 
216 aa  108  9.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.26 
 
 
227 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  31.36 
 
 
252 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  31.75 
 
 
214 aa  102  5e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0019  phosphatase  30.65 
 
 
208 aa  102  6e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.379676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  32.77 
 
 
252 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  32.77 
 
 
252 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  32.77 
 
 
252 aa  101  8e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  32.77 
 
 
252 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  32.06 
 
 
245 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  32.06 
 
 
242 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  32.06 
 
 
242 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  32.06 
 
 
242 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  32.06 
 
 
245 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  32.06 
 
 
242 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  32.06 
 
 
242 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  30.92 
 
 
223 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  30.88 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
217 aa  98.2  8e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  31.51 
 
 
232 aa  98.2  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.86 
 
 
206 aa  98.2  9e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  29.66 
 
 
252 aa  97.8  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  29.66 
 
 
252 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.66 
 
 
252 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  29.66 
 
 
252 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  29.66 
 
 
252 aa  97.4  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2787  phosphoglycolate phosphatase  32.56 
 
 
221 aa  97.4  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00496025  hitchhiker  0.0014162 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  29.24 
 
 
252 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
238 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 
227 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  36.02 
 
 
228 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  29.24 
 
 
252 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  29.24 
 
 
252 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  29.24 
 
 
252 aa  95.1  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.49 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  32.3 
 
 
233 aa  94.4  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  28.11 
 
 
225 aa  94  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  28.96 
 
 
234 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 
226 aa  94  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  32.26 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
234 aa  92.4  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  29.82 
 
 
228 aa  92  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 
238 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  32.87 
 
 
214 aa  92  7e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
250 aa  92  7e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  31.62 
 
 
253 aa  91.7  9e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  31.65 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 
221 aa  90.9  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  33.82 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  31.14 
 
 
235 aa  90.9  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  31.86 
 
 
240 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  30.95 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  31.08 
 
 
232 aa  90.9  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  31.08 
 
 
232 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  29.49 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  31.96 
 
 
237 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  31.08 
 
 
232 aa  90.9  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  28.23 
 
 
221 aa  90.5  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  31.8 
 
 
213 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.73 
 
 
217 aa  90.1  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.8 
 
 
213 aa  89.7  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  32.42 
 
 
229 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.91 
 
 
217 aa  89.7  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 
227 aa  89.4  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  30.57 
 
 
235 aa  89.4  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.28 
 
 
230 aa  89.4  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 
221 aa  89  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  31.78 
 
 
230 aa  89  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  31.47 
 
 
226 aa  89  6e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>