More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1661 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1661  AHBA synthesis associated protein  100 
 
 
214 aa  417  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.49792 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0431  3-amino-5-hydroxybenoic acid synthesis related  74.4 
 
 
263 aa  300  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4839  AHBA synthesis associated protein  70.39 
 
 
237 aa  278  6e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.0397379 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3289  AHBA synthesis associated protein  66.51 
 
 
264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1257  AHBA synthesis associated protein  65.05 
 
 
228 aa  255  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136935  hitchhiker  0.0000231922 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.73 
 
 
296 aa  104  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.36 
 
 
207 aa  99  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.86 
 
 
216 aa  95.9  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0100  HAD family hydrolase  31.22 
 
 
468 aa  95.1  7e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  33.94 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  38.06 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.87 
 
 
219 aa  92  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  30.04 
 
 
215 aa  92  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.44 
 
 
218 aa  91.3  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  32.03 
 
 
252 aa  90.1  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  31.46 
 
 
222 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.26 
 
 
217 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3547  phosphoglycolate phosphatase  33.51 
 
 
238 aa  89.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  89.7  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  89.4  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.57 
 
 
209 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490459 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  89  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  31.6 
 
 
252 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0927  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
210 aa  88.6  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  36.02 
 
 
221 aa  88.2  9e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.27 
 
 
225 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.56 
 
 
230 aa  87.8  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  25.7 
 
 
216 aa  87.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  30.14 
 
 
222 aa  87  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.95 
 
 
215 aa  86.7  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.8 
 
 
225 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  26.76 
 
 
214 aa  86.7  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  32.03 
 
 
252 aa  87  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0391  phosphoglycolate phosphatase  29.33 
 
 
216 aa  87  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1092  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.3 
 
 
212 aa  86.3  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  29.3 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.8 
 
 
221 aa  86.7  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3036  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 
224 aa  85.9  4e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0038441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  27.39 
 
 
216 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4276  HAD superfamily hydrolase  31.32 
 
 
220 aa  85.5  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2502  HAD family hydrolase  37.98 
 
 
200 aa  85.1  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.396303  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  31.51 
 
 
217 aa  84.7  8e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1899  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.68 
 
 
212 aa  84.7  9e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000244384  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
225 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  30.73 
 
 
209 aa  84.7  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  33.92 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  30.14 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  25.65 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  33.02 
 
 
219 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
252 aa  84  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  26.96 
 
 
216 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.69 
 
 
220 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  26.96 
 
 
216 aa  83.2  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.76 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  26.96 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  26.96 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  31.19 
 
 
227 aa  82.8  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  31.05 
 
 
223 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  30.23 
 
 
224 aa  82.8  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4575  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.31 
 
 
236 aa  82  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  31.37 
 
 
214 aa  82  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  30.67 
 
 
213 aa  81.6  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.05 
 
 
206 aa  81.6  0.000000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  30.84 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  26.52 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.69 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  30.43 
 
 
221 aa  81.3  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.67 
 
 
213 aa  81.3  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  26.52 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  30.84 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1535  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35 
 
 
209 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.918107 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  26.52 
 
 
216 aa  80.9  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.52 
 
 
227 aa  81.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3956  HAD superfamily hydrolase  30.98 
 
 
220 aa  80.1  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.945579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  26.01 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.37 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  38.76 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  34.03 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  31.08 
 
 
226 aa  80.1  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  35.37 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  25.82 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  35.14 
 
 
216 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  33.01 
 
 
215 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.01 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0919  HAD family hydrolase  28.02 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000975491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3945  HAD superfamily hydrolase  30.98 
 
 
221 aa  79  0.00000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4222  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.98 
 
 
220 aa  79  0.00000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  32.97 
 
 
291 aa  79  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  36.84 
 
 
234 aa  79  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  30.3 
 
 
233 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  31.41 
 
 
217 aa  79  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2777  HAD family hydrolase  25.82 
 
 
220 aa  78.6  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0810098  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4313  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.22 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>