More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0484 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  70.81 
 
 		 213 aa  306  1.0000000000000001e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  70.81 
 
 		 213 aa  305  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  63.85 
 
 		 227 aa  284  7e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  63.21 
 
 		 216 aa  276  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.95 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 222 aa  111  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  31.58 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.81 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0569787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0907  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  38.81 
 
 		 219 aa  109  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464753  normal  0.0304334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  38.28 
 
 		 230 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  34.62 
 
 		 219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1042  putative phosphoglycolate phosphatase protein  39.32 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0803838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  37.62 
 
 		 230 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  32.54 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  30.05 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2206  HAD family hydrolase  34.16 
 
 		 227 aa  104  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0834963  normal  0.088242 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  33.82 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0391  HAD family hydrolase  34.36 
 
 		 229 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  36.49 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 234 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  31.92 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.54 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  33.65 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1355  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.88 
 
 		 228 aa  98.2  7e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.873579  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 260 aa  98.6  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  33.78 
 
 		 219 aa  98.2  8e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.1 
 
 		 219 aa  98.2  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 224 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  35.44 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.43 
 
 		 222 aa  96.7  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.9 
 
 		 222 aa  94.7  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.49 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  32.7 
 
 		 220 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.95 
 
 		 218 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 216 aa  94.7  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.61 
 
 		 219 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  33.18 
 
 		 226 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1650  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  28.17 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 221 aa  90.9  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  32.46 
 
 		 232 aa  90.9  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1470  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.23 
 
 		 213 aa  90.9  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000674726  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  28.04 
 
 		 215 aa  90.1  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  31.28 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4225  phosphatase-like  35.64 
 
 		 219 aa  89.7  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1323  HAD family hydrolase  32.43 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00010916  normal  0.934661 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  30.48 
 
 		 214 aa  89.7  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 		 232 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1 family protein  27.4 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0490965  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2800  HAD superfamily hydrolase  35.64 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00584417  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2916  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.64 
 
 		 237 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0271792  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0095  HAD family hydrolase  26.09 
 
 		 212 aa  89.4  4e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  31.07 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2861  HAD superfamily hydrolase  35.64 
 
 		 219 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0565933  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0993  HAD family hydrolase  34.27 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1709  haloacid dehalogenase-like hydrolase  35.15 
 
 		 222 aa  89  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0748768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  30.7 
 
 		 219 aa  88.6  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  28.22 
 
 		 217 aa  88.6  7e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1640  HAD family hydrolase  31.75 
 
 		 220 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.284861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0989  HAD family hydrolase  34.16 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  31.41 
 
 		 223 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  31.43 
 
 		 236 aa  87.4  1e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  30.05 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  31.36 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4082  phosphoglycolate phosphatase  29.65 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867536  normal  0.225586 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  31.36 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  31.43 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1722  HAD family hydrolase  30.62 
 
 		 228 aa  87  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2191  HAD family hydrolase  35.64 
 
 		 219 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0671825 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  30.09 
 
 		 215 aa  87  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  31.36 
 
 		 225 aa  87  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.56 
 
 		 217 aa  87  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  29.33 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  29.77 
 
 		 229 aa  86.3  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  31.46 
 
 		 231 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0633  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.32289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1113  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 219 aa  86.3  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970841  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  30.89 
 
 		 223 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  32.82 
 
 		 221 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  27.65 
 
 		 272 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  26.19 
 
 		 227 aa  85.9  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  30.69 
 
 		 223 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  26.51 
 
 		 225 aa  85.5  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  25.91 
 
 		 227 aa  85.5  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19180  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.62 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.143986  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  28.33 
 
 		 252 aa  85.9  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  28.22 
 
 		 221 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  30.26 
 
 		 219 aa  85.5  6e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2726  phosphoglycolate phosphatase  27.35 
 
 		 223 aa  85.1  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.658118  hitchhiker  0.000458503 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  30.2 
 
 		 222 aa  85.1  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  28.96 
 
 		 209 aa  85.1  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1071  HAD family hydrolase  34.65 
 
 		 219 aa  85.1  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357132  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  30.29 
 
 		 233 aa  85.1  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1709  HAD family hydrolase  30.43 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000621435  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4786  HAD family hydrolase  31.25 
 
 		 225 aa  84.7  9e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.480444 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  27.78 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1712  HAD family hydrolase  30.77 
 
 		 239 aa  84.7  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000827821  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  28.39 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>