More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3408 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_3357  HAD family hydrolase  100 
 
 
225 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.563769  normal  0.442665 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3346  HAD family hydrolase  100 
 
 
225 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.307883  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3408  HAD family hydrolase  100 
 
 
225 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.155839  normal  0.682192 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12262  hypothetical protein  72.77 
 
 
291 aa  315  4e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2889  HAD family hydrolase  77.1 
 
 
228 aa  315  5e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.119829  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3621  HAD family hydrolase  74.24 
 
 
228 aa  291  5e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3098  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  53.64 
 
 
228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0621452  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35600  predicted phosphatase  51.46 
 
 
220 aa  178  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3458  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  49.32 
 
 
252 aa  156  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00396228  hitchhiker  0.00386241 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  50.27 
 
 
231 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0760  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  45.79 
 
 
220 aa  148  7e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.133542 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2284  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.73 
 
 
223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2445  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  45.5 
 
 
232 aa  142  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0477823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02117  indigoidine synthesis like protein  43.32 
 
 
214 aa  140  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2250  HAD superfamily hydrolase  39.13 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2045  HAD family hydrolase  40.64 
 
 
225 aa  139  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.143641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2064  HAD superfamily hydrolase  40.76 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2220  HAD superfamily hydrolase  40.76 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2202  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.83 
 
 
221 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.958257  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3123  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  38.83 
 
 
221 aa  138  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0025393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  47.57 
 
 
229 aa  138  7e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2332  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  39.13 
 
 
221 aa  137  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000150125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2004  phosphoglycolate phosphatase  40.22 
 
 
221 aa  137  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000935232  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2248  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  40.22 
 
 
221 aa  136  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.2381099999999995e-27 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1212  hypothetical protein  38.39 
 
 
219 aa  136  2e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0173059  normal  0.0170431 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2003  phosphoglycolate phosphatase  38.28 
 
 
221 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.196564  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1453  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  43.3 
 
 
228 aa  135  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.781565 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1720  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.68 
 
 
222 aa  134  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.739414  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3215  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.22 
 
 
217 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.246246 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0568  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  50.27 
 
 
226 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.939008  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4457  HAD family hydrolase  38.83 
 
 
215 aa  132  6e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4333  HAD family hydrolase  38.74 
 
 
218 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0092  HAD family hydrolase  36.79 
 
 
216 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3563  hydrolase  45.74 
 
 
232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0109  HAD family hydrolase  36.82 
 
 
224 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000398417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0065  hypothetical protein  38.29 
 
 
221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0094  HAD superfamily hydrolase  37.38 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0048007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1821  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.28 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000701178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0112  HAD family hydrolase  34.23 
 
 
224 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0709114  normal  0.0897877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0109  HAD family hydrolase  37.38 
 
 
237 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00770  hypothetical protein  37.84 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1139  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.62 
 
 
217 aa  125  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.652563  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0795  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.61 
 
 
244 aa  122  4e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3263  HAD family hydrolase  36.76 
 
 
216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1301  HAD superfamily hydrolase  35.29 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.193279  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08880  predicted phosphatase  37.45 
 
 
247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0898254  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1248  putative phosphatase  35.29 
 
 
245 aa  116  3e-25  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0320167  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0174  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.93 
 
 
221 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000420461  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  35.55 
 
 
221 aa  112  5e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0956  phosphatase, putative  34.95 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000103613  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3203  hydrolase  36.98 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0025  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase family protein  41.88 
 
 
219 aa  108  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412211  normal  0.132054 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0469  phosphatase  35.78 
 
 
239 aa  108  8.000000000000001e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.876662  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2080  hydrolase  38.3 
 
 
231 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.025582  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2186  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.04 
 
 
221 aa  104  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2535  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.11 
 
 
220 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2643  HAD family hydrolase  35.07 
 
 
227 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735097  normal  0.197279 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0209  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.9 
 
 
235 aa  103  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.415502  normal  0.0513274 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1536  haloacid dehalogenase-like hydrolase  33.33 
 
 
223 aa  99.8  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.344514  normal  0.620103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3898  phosphoglycolate phosphatase  33.97 
 
 
221 aa  98.6  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.67393 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1603  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.61 
 
 
219 aa  98.6  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.699082  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.48 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  37.97 
 
 
296 aa  93.6  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  33.69 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  31.13 
 
 
215 aa  92  7e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  30.19 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  32.26 
 
 
216 aa  89  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0006  phosphoglycolate phosphatase  31.05 
 
 
226 aa  88.2  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.537352  normal  0.527818 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  29.72 
 
 
212 aa  88.2  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.46 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  34.85 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  30.19 
 
 
216 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  31.89 
 
 
216 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5010  pyrophosphatase PpaX  30.66 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.36 
 
 
218 aa  87  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5390  pyrophosphatase PpaX  30.66 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  30.09 
 
 
216 aa  87  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  30.09 
 
 
216 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0387  conserved hypothetical protein, putative HAD superfamily hydrolase  27.27 
 
 
214 aa  87  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.322414  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  30.19 
 
 
216 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  30.37 
 
 
222 aa  86.3  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  30.19 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  30.19 
 
 
216 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.59 
 
 
226 aa  85.9  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  31.16 
 
 
234 aa  85.9  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
222 aa  85.9  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  32.57 
 
 
216 aa  85.1  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  30.62 
 
 
213 aa  85.1  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.11 
 
 
219 aa  84.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.62 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  30.19 
 
 
216 aa  84  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1600  pyrophosphatase PpaX  24.2 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000092205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2449  HAD family hydrolase  27.57 
 
 
217 aa  82.4  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0190416  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.48 
 
 
225 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 
235 aa  82  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  30.05 
 
 
215 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  29.51 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  36.65 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  30.62 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0886  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.18 
 
 
236 aa  79.3  0.00000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0500332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>