More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1080 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  100 
 
 
218 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.19 
 
 
217 aa  180  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  45.58 
 
 
224 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  41.71 
 
 
220 aa  180  2e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  43.33 
 
 
220 aa  176  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  42.06 
 
 
225 aa  169  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.35 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  39.81 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.19 
 
 
221 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  38.03 
 
 
216 aa  155  3e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.73 
 
 
218 aa  152  4e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  39.23 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.79 
 
 
220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.56 
 
 
219 aa  145  6e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.28 
 
 
217 aa  144  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  36.36 
 
 
215 aa  143  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.96 
 
 
217 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  37.04 
 
 
229 aa  142  5e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  37.91 
 
 
220 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  33.49 
 
 
218 aa  128  6e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.92 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  39.11 
 
 
218 aa  125  7e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  36.5 
 
 
218 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.51 
 
 
217 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  38.58 
 
 
233 aa  118  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  39.32 
 
 
233 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.58 
 
 
216 aa  113  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.88 
 
 
216 aa  111  8.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  29.17 
 
 
235 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1983  Phosphoglycolate phosphatase  34.78 
 
 
257 aa  108  9.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
227 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
227 aa  107  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  37.14 
 
 
227 aa  107  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
227 aa  106  3e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  34.86 
 
 
226 aa  105  4e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.89 
 
 
226 aa  105  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  34.88 
 
 
230 aa  105  6e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  37.44 
 
 
209 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  34.92 
 
 
234 aa  104  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  34.39 
 
 
234 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  32.02 
 
 
226 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 
227 aa  102  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0954  phosphoglycolate phosphatase  35.26 
 
 
233 aa  102  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  34.54 
 
 
243 aa  101  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  35.45 
 
 
224 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 
227 aa  100  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  31.25 
 
 
226 aa  100  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  32.71 
 
 
226 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.32 
 
 
222 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.05 
 
 
216 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  36.49 
 
 
209 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3387  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
225 aa  99.8  3e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0781845 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 
222 aa  99.4  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1371  phosphoglycolate phosphatase  35.65 
 
 
222 aa  99.4  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.203788  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  29.09 
 
 
225 aa  99  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
233 aa  99  5e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2571  phosphoglycolate phosphatase  34.63 
 
 
233 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0542226 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  33.02 
 
 
228 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2193  phosphoglycolate phosphatase  33.16 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.83571  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  34.63 
 
 
233 aa  97.8  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  33.98 
 
 
225 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  31.65 
 
 
223 aa  97.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 
227 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  30.92 
 
 
227 aa  96.7  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 
221 aa  97.1  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2151  flagellar biosynthesis chaperone FliJ-like protein  31.94 
 
 
228 aa  97.1  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2075  phosphoglycolate phosphatase  34.21 
 
 
228 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.299627  normal  0.323596 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  33.78 
 
 
214 aa  97.4  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2054  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 
225 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  36.02 
 
 
209 aa  96.7  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.52 
 
 
222 aa  96.7  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 
228 aa  96.3  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  29.3 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  34.63 
 
 
233 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  33.94 
 
 
241 aa  95.9  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  33.78 
 
 
226 aa  95.9  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0440  phosphoglycolate phosphatase  34.43 
 
 
235 aa  95.9  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.433387 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1479  phosphoglycolate phosphatase  33.87 
 
 
231 aa  95.9  5e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.781791  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  28.84 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  28.84 
 
 
225 aa  95.5  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5953  phosphoglycolate phosphatase  32.24 
 
 
257 aa  95.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0174691 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 
231 aa  95.1  7e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  35.45 
 
 
246 aa  95.1  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  28.84 
 
 
225 aa  95.1  7e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0363  phosphoglycolate phosphatase  33.79 
 
 
261 aa  94.7  9e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  32.08 
 
 
227 aa  94  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  28.9 
 
 
228 aa  94.4  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  32.72 
 
 
226 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
227 aa  94  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  31.36 
 
 
229 aa  94  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1823  phosphoglycolate phosphatase  32.54 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  27.73 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1500  phosphoglycolate phosphatase  32.54 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0783789  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  31.34 
 
 
229 aa  93.6  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 
225 aa  92.8  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  35.75 
 
 
461 aa  92.8  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  31.47 
 
 
229 aa  93.2  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  31.82 
 
 
241 aa  92.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>