More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2874 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2874  HAD family hydrolase  100 
 
 
231 aa  478  1e-134  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.5302  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0033  HAD family hydrolase  37.38 
 
 
221 aa  151  7e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2894  phosphoglycolate phosphatase  37.73 
 
 
243 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.225583 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1175  HAD family hydrolase  35.81 
 
 
241 aa  141  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.542362  normal  0.617727 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1535  HAD family hydrolase  34.42 
 
 
213 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00037807  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  34.55 
 
 
228 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0472  HAD family hydrolase  35.65 
 
 
261 aa  121  9.999999999999999e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.523945  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0992  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.74 
 
 
235 aa  118  7e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0708331 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1179  HAD family hydrolase  28.8 
 
 
231 aa  88.6  8e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.269982  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0250  HAD family hydrolase  26.43 
 
 
225 aa  86.7  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  29.9 
 
 
227 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0264  hypothetical protein  26.6 
 
 
211 aa  84.7  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.247484 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0186  HAD family hydrolase  24.34 
 
 
225 aa  78.6  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0746  HAD family hydrolase  24.56 
 
 
225 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  30 
 
 
227 aa  76.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1642  HAD family hydrolase  25.89 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1576  HAD family hydrolase  25.89 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  29.53 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1716  HAD family hydrolase  24.34 
 
 
225 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.204588  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3482  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 
226 aa  75.9  0.0000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.824519  normal  0.190106 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  29.38 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
238 aa  75.1  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  33.09 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  36.29 
 
 
209 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3752  HAD family hydrolase  30.73 
 
 
237 aa  72.4  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  29 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
224 aa  72  0.000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14061  hypothetical protein  26.29 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.180582  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  36.09 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  32.84 
 
 
215 aa  71.2  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  38.05 
 
 
230 aa  70.5  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3992  HAD family hydrolase  29.47 
 
 
220 aa  70.5  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09020  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.04 
 
 
234 aa  70.1  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.532277  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3798  phosphoglycolate phosphatase  30.45 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0419361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  29.02 
 
 
266 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  27.8 
 
 
243 aa  69.7  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2297  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.93 
 
 
268 aa  69.3  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3679  phosphoglycolate phosphatase  29.34 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.966867  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1566  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.25 
 
 
263 aa  68.9  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3681  phosphoglycolate phosphatase  29.34 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123155  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2493  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3754  phosphoglycolate phosphatase  29.34 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3850  phosphoglycolate phosphatase  29.34 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3788  phosphoglycolate phosphatase  32.65 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 
256 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  29.02 
 
 
272 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  31.62 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  33.83 
 
 
228 aa  66.6  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3022  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116956  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0649  HAD family hydrolase  29.84 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
254 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  26.32 
 
 
272 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0634  HAD family hydrolase  29.84 
 
 
239 aa  66.2  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  27.59 
 
 
240 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  26.32 
 
 
272 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  26.32 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  30.26 
 
 
225 aa  65.5  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
251 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03237  phosphoglycolate phosphatase  28.1 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0328  phosphoglycolate phosphatase  28.1 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  26.36 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1053  HAD family hydrolase  23.27 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.594873  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  32.59 
 
 
215 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03189  hypothetical protein  28.1 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  36.89 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0440  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
251 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.122838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1773  HAD family hydrolase  27.8 
 
 
227 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  27.03 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  27.03 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  29.44 
 
 
254 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3762  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.40481  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5677  pyrophosphatase PpaX  32.59 
 
 
216 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  28.14 
 
 
218 aa  64.3  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1151  HAD family hydrolase  26.73 
 
 
219 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.205266  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5265  pyrophosphatase PpaX  31.85 
 
 
216 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4689  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.663349  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1629  phosphoglycolate phosphatase  36.27 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3581  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.284383  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  32.59 
 
 
216 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.06 
 
 
221 aa  63.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0328  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 
252 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372389  normal  0.201922 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0735  phosphoglycolate phosphatase  28.43 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.442963  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3012  phosphoglycolate phosphatase  34.55 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0258131  normal  0.0275568 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3661  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 
252 aa  63.5  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.29844  normal  0.025681 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5322  pyrophosphatase PpaX  31.85 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  26.32 
 
 
272 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1798  phosphoglycolate phosphatase  29.61 
 
 
221 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0263592  unclonable  0.00000282508 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3854  phosphoglycolate phosphatase  31.72 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00525883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 
225 aa  63.2  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  25.97 
 
 
228 aa  63.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4839  pyrophosphatase PpaX  31.85 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4854  pyrophosphatase PpaX  31.85 
 
 
216 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  34.51 
 
 
232 aa  62.8  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5246  pyrophosphatase PpaX  31.85 
 
 
216 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2581  phosphoglycolate phosphatase  32.56 
 
 
221 aa  62.8  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0971  2-phosphoglycolate phosphatase  34.55 
 
 
237 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.080581  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2479  phosphoglycolate phosphatase  27.98 
 
 
228 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0669626  normal  0.547058 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3193  phosphoglycolate phosphatase  28.29 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>