More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2716 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.76 
 
 		 216 aa  168  7e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.49 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  36.15 
 
 		 225 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.26 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  38.53 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.11 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  37.21 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.62 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.92 
 
 		 220 aa  142  4e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.21 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  35.78 
 
 		 229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  36.49 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.8 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  34.56 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.74 
 
 		 220 aa  131  6e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.02 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.49 
 
 		 218 aa  128  6e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  35.38 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  31.82 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.46 
 
 		 226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  32.46 
 
 		 216 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.66 
 
 		 217 aa  111  7.000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.41 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.08 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.41 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.33 
 
 		 222 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  32.39 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  32.68 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  32.39 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.83 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  33.65 
 
 		 272 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.58 
 
 		 226 aa  104  8e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  31.92 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  30.66 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  29.77 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0956  phosphoglycolate phosphatase  30.56 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  32.56 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  31.46 
 
 		 209 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4555  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 		 461 aa  102  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.82365  normal  0.133597 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.79 
 
 		 219 aa  102  6e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  27.65 
 
 		 235 aa  101  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.04 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3878  phosphoglycolate phosphatase  28.5 
 
 		 234 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  28.17 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2324  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.289687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  31.16 
 
 		 272 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  28.77 
 
 		 216 aa  98.2  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  28.51 
 
 		 227 aa  98.2  9e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0265  phosphoglycolate phosphatase  28.7 
 
 		 232 aa  97.4  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.210779  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4055  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 		 234 aa  97.8  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0278697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  30.14 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  32.55 
 
 		 209 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3961  phosphoglycolate phosphatase  28.3 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.512442  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0230  phosphoglycolate phosphatase  28.3 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.135549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3722  phosphoglycolate phosphatase  28.3 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0244843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  30.65 
 
 		 272 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 		 227 aa  95.9  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 		 266 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 		 256 aa  95.9  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 		 227 aa  95.5  5e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  28.25 
 
 		 227 aa  95.1  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  28.25 
 
 		 226 aa  95.1  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  30.77 
 
 		 217 aa  95.1  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  31.13 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0343  phosphoglycolate phosphatase  26.94 
 
 		 233 aa  94  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  28.97 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 		 226 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 		 272 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  31.35 
 
 		 209 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  27.67 
 
 		 227 aa  92.4  4e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 		 225 aa  92.4  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0838  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.681144  normal  0.099255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 		 225 aa  91.7  8e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  27.15 
 
 		 225 aa  90.9  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  28.37 
 
 		 272 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0767  phosphoglycolate phosphatase  26.85 
 
 		 229 aa  90.9  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.54601  hitchhiker  0.00790762 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  29.9 
 
 		 272 aa  89.7  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1278  phosphoglycolate phosphatase  32.34 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.546429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2937  phosphoglycolate phosphatase  32.34 
 
 		 218 aa  89.7  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 		 229 aa  89.4  4e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3219  phosphoglycolate phosphatase  29.72 
 
 		 232 aa  89  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  26.73 
 
 		 228 aa  89  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1529  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  29.15 
 
 		 234 aa  89  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  28.57 
 
 		 226 aa  88.6  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1058  phosphoglycolate phosphatase  30.95 
 
 		 227 aa  87.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.234796  normal  0.363243 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 257 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  28.04 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  29.63 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  29.03 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2118  HAD family hydrolase  28.44 
 
 		 235 aa  87  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0525  HAD family hydrolase  28.77 
 
 		 209 aa  87  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00124351  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  26.67 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  27.57 
 
 		 223 aa  86.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4600  phosphoglycolate phosphatase  28.57 
 
 		 232 aa  87.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.383007  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>