More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_14060 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  100 
 
 
217 aa  444  1.0000000000000001e-124  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  50.7 
 
 
218 aa  214  5.9999999999999996e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  45.32 
 
 
216 aa  170  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  42.25 
 
 
218 aa  159  4e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.26 
 
 
221 aa  149  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  41.23 
 
 
224 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.07 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  38.5 
 
 
225 aa  139  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  34.11 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.96 
 
 
219 aa  137  1e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  35.24 
 
 
215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  39.8 
 
 
220 aa  132  5e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.15 
 
 
219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.38 
 
 
220 aa  128  7.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.56 
 
 
220 aa  128  9.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.71 
 
 
220 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.75 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.74 
 
 
217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  36.94 
 
 
229 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.51 
 
 
218 aa  119  3e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  39.71 
 
 
209 aa  113  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  35.12 
 
 
217 aa  112  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  39.23 
 
 
209 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  32.41 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.65 
 
 
226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.49 
 
 
217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  38.28 
 
 
209 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  35.29 
 
 
223 aa  106  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  33.95 
 
 
229 aa  105  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 
272 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 
272 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 
248 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  34.62 
 
 
227 aa  102  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  39.15 
 
 
209 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  32.58 
 
 
243 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2310  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
221 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.523408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  34.85 
 
 
272 aa  101  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  35.6 
 
 
224 aa  101  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  32.41 
 
 
226 aa  101  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1458  phosphoglycolate phosphatase  32.3 
 
 
231 aa  100  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.677189  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  33.18 
 
 
217 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  32.24 
 
 
233 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 
232 aa  100  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  31.36 
 
 
229 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 
240 aa  100  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
234 aa  99.4  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.66 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
272 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  29.77 
 
 
238 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  34.34 
 
 
272 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0507  phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 
254 aa  99  5e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.263743  normal  0.890695 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  30.41 
 
 
234 aa  98.6  6e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2570  phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 
254 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0535  phosphoglycolate phosphatase  31.1 
 
 
254 aa  98.6  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 
225 aa  98.6  7e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
228 aa  98.2  7e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  31.94 
 
 
227 aa  98.6  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  32.88 
 
 
246 aa  98.2  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  32.45 
 
 
233 aa  98.2  8e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  30.28 
 
 
273 aa  98.2  9e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  31.46 
 
 
228 aa  97.8  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  29.95 
 
 
238 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
245 aa  97.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  33.84 
 
 
272 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
242 aa  97.8  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  30.56 
 
 
225 aa  97.4  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  31.94 
 
 
227 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  32.32 
 
 
226 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  32.21 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  30.56 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  30.09 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  32.07 
 
 
209 aa  96.3  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3622  2-phosphoglycolate phosphatase  30.62 
 
 
254 aa  96.3  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  30.09 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
218 aa  96.3  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.2 
 
 
233 aa  96.3  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4462  phosphoglycolate phosphatase  32.29 
 
 
250 aa  96.3  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  35.64 
 
 
221 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  31.48 
 
 
227 aa  95.9  4e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.68 
 
 
233 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.96 
 
 
222 aa  94.7  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  28.24 
 
 
220 aa  94  1e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1985  phosphoglycolate phosphatase  31.6 
 
 
223 aa  94.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.554471  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  30.48 
 
 
242 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2859  phosphoglycolate phosphatase  32.23 
 
 
256 aa  94.4  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.430899  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1483  phosphoglycolate phosphatase  33.67 
 
 
231 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.539513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  31.73 
 
 
221 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0464  phosphoglycolate phosphatase  30.81 
 
 
251 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.992467  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0261  HAD family hydrolase  33.17 
 
 
217 aa  94  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000130583  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2110  phosphoglycolate phosphatase  30.1 
 
 
225 aa  93.2  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.782136  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  27.93 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  31.02 
 
 
226 aa  92.8  3e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  32.31 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  29.58 
 
 
226 aa  93.2  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>