More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1144 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3382  HAD family hydrolase  48.85 
 
 		 217 aa  208  6e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.424816 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1684  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.78 
 
 		 220 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000256212  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0824  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  43.98 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  43.12 
 
 		 225 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  43.06 
 
 		 229 aa  192  3e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  44.7 
 
 		 219 aa  191  8e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1252  HAD family hydrolase  43.78 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1222  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  42.86 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  39.81 
 
 		 215 aa  182  3e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1932  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  40.85 
 
 		 218 aa  176  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1646  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.33 
 
 		 217 aa  169  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0258  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  41.2 
 
 		 220 aa  169  3e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.96 
 
 		 221 aa  165  4e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  40.74 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0696  phosphoglycolate phosphatase  36.07 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.202819  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1080  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.96 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.00830882  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3061  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  37.17 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  35.02 
 
 		 216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2716  HAD family hydrolase  33.8 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000772309  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00150  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  40.09 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.11 
 
 		 217 aa  132  6e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1983  Phosphoglycolate phosphatase  42.13 
 
 		 257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14060  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  34.74 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  38.27 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3132  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.64 
 
 		 226 aa  112  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0156  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.81 
 
 		 216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.47 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.31745 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3084  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  33.64 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  41.57 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1102  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.88 
 
 		 219 aa  106  3e-22  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  35.86 
 
 		 226 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 		 226 aa  104  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  34.74 
 
 		 209 aa  104  1e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  33.82 
 
 		 227 aa  103  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3116  phosphoglycolate phosphatase  30.84 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0121451 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  33.83 
 
 		 227 aa  102  6e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  31.08 
 
 		 225 aa  101  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1957  phosphoglycolate phosphatase  33.49 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.83 
 
 		 222 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  32.51 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  36.82 
 
 		 223 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2829  phosphoglycolate phosphatase  32.11 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0461088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2496  phosphoglycolate phosphatase  31.28 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  34 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3277  phosphoglycolate phosphatase  32.57 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0806752  normal  0.284074 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1514  phosphoglycolate phosphatase  33.5 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00414525  decreased coverage  0.0000736152 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 		 272 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 		 272 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20950  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  35.14 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 		 224 aa  99.8  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 235 aa  99.8  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 		 272 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1730  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 238 aa  99.4  4e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23210  phosphoglycolate phosphatase  33.03 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0343323  hitchhiker  0.00416895 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0457  phosphoglycolate phosphatase  31.65 
 
 		 227 aa  99  5e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  34.47 
 
 		 226 aa  98.2  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  31.34 
 
 		 218 aa  98.2  9e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  35.58 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0945  putative 2-phosphoglycolate phosphatase  34.4 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  32 
 
 		 272 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  29.55 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 227 aa  96.7  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  35.71 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  31.63 
 
 		 272 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  29.55 
 
 		 227 aa  97.4  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  29.09 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  32.09 
 
 		 272 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2065  HAD family hydrolase  33.84 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0943577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  28.7 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  33.85 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  31.41 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  28.64 
 
 		 227 aa  96.3  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2132  HAD family hydrolase  32.98 
 
 		 220 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1399  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 		 225 aa  95.9  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  36.19 
 
 		 209 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  32.86 
 
 		 229 aa  95.9  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1764  phosphoglycolate phosphatase  31.19 
 
 		 223 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  35.24 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3482  phosphoglycolate phosphatase  31.41 
 
 		 228 aa  95.5  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.875502  normal  0.981101 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2461  phosphoglycolate phosphatase  29.91 
 
 		 225 aa  95.1  7e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.768725 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 225 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2289  HAD family hydrolase  32.55 
 
 		 223 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000247556  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3950  phosphoglycolate phosphatase  31.19 
 
 		 223 aa  94.7  8e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00428214  normal  0.0156244 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 225 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  27.85 
 
 		 235 aa  95.1  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  28.77 
 
 		 225 aa  94.7  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2060  HAD family hydrolase  32.27 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00381556  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  33.17 
 
 		 266 aa  94  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1508  phosphoglycolate phosphatase  31.8 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.313556  normal  0.0200123 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1355  phosphoglycolate phosphatase  30.73 
 
 		 223 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  33.85 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2472  phosphoglycolate phosphatase  31.8 
 
 		 218 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  30.54 
 
 		 226 aa  94  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4716  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.92014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2406  HAD family hydrolase  32.41 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0211635  unclonable  0.0000117739 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  34.9 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2056  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  32.27 
 
 		 223 aa  94  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0324232  unclonable  0.00000000000163854 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  34.72 
 
 		 229 aa  93.2  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>