More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1784 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1784  HAD family hydrolase  100 
 
 
226 aa  466  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.889068  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2251  phosphoglycolate phosphatase  37.56 
 
 
229 aa  138  8.999999999999999e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  38.34 
 
 
214 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1187  phosphoglycolate phosphatase  36.62 
 
 
218 aa  128  9.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00990405  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2192  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 
217 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0401  phosphoglycolate phosphatase  36.28 
 
 
209 aa  126  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0261  phosphoglycolate phosphatase  34.09 
 
 
226 aa  124  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2290  HAD family hydrolase  36.84 
 
 
223 aa  124  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.783453  normal  0.134252 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3361  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 
227 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  32.42 
 
 
225 aa  123  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3996  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 
225 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4258  phosphoglycolate phosphatase  32.24 
 
 
235 aa  123  3e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0125483 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4106  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 
225 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0347  phosphoglycolate phosphatase  34.2 
 
 
235 aa  123  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0447  phosphoglycolate phosphatase  37.31 
 
 
272 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.558752 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3887  phosphoglycolate phosphatase  35.32 
 
 
227 aa  122  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.379252 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4076  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 
225 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4194  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 
225 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3691  phosphoglycolate phosphatase  37.31 
 
 
227 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0220  phosphoglycolate phosphatase  34.56 
 
 
231 aa  122  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0486776 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0293  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 
227 aa  121  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0416  phosphoglycolate phosphatase  37.31 
 
 
272 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0450  phosphoglycolate phosphatase  37.31 
 
 
272 aa  121  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0254  phosphoglycolate phosphatase  35.32 
 
 
227 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3699  phosphoglycolate phosphatase  35.41 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  37.38 
 
 
226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07930  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282972 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2097  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.96 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.284323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0567  phosphoglycolate phosphatase  37.5 
 
 
266 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0752  phosphoglycolate phosphatase  36.65 
 
 
272 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3246  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 
227 aa  118  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.181824  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2847  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 
227 aa  118  7e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.212796  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0176  phosphoglycolate phosphatase  32.88 
 
 
224 aa  118  7e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.790253  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 
272 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  36.08 
 
 
232 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5119  phosphoglycolate phosphatase  36.79 
 
 
272 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0743  phosphoglycolate phosphatase  34.11 
 
 
225 aa  117  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4786  phosphoglycolate phosphatase  35.94 
 
 
272 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.602175 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2229  phosphoglycolate phosphatase  35 
 
 
227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.40738  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02162  phosphoglycolate phosphatase  34.88 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002270  phosphoglycolate phosphatase  36.32 
 
 
228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  33.64 
 
 
226 aa  115  5e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0414  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0245  phosphoglycolate phosphatase  32.43 
 
 
232 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0976  HAD family hydrolase  35.19 
 
 
225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3516  phosphoglycolate phosphatase  35.81 
 
 
229 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  31.68 
 
 
237 aa  111  7.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2363  phosphoglycolate phosphatase  32.26 
 
 
227 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.496506  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  35.51 
 
 
224 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2083  phosphoglycolate phosphatase  36.46 
 
 
226 aa  111  8.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.609164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6944  phosphoglycolate phosphatase  37.61 
 
 
257 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0268  phosphoglycolate phosphatase  34.56 
 
 
228 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0557534  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2583  phosphoglycolate phosphatase  34.36 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3122  phosphoglycolate phosphatase  35.35 
 
 
248 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.571446  normal  0.270174 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  37.06 
 
 
221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0382  phosphoglycolate phosphatase  31.39 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0643  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 
242 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0534  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 
242 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0250125  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3582  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 
245 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3574  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 
242 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.952116  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1909  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 
242 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3555  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 
245 aa  109  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.221388  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0939  phosphoglycolate phosphatase  35.05 
 
 
242 aa  109  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0783  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.83 
 
 
222 aa  109  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0460  phosphoglycolate phosphatase  35.57 
 
 
229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0934432  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2370  phosphoglycolate phosphatase  35.23 
 
 
227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46650  phosphoglycolate phosphatase  37.17 
 
 
233 aa  108  6e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2908  phosphoglycolate phosphatase  34.01 
 
 
242 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0462  2-phosphoglycolate phosphatase  32.64 
 
 
238 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00083  phosphoglycolate phosphatase  35.43 
 
 
228 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1089  phosphoglycolate phosphatase  33.33 
 
 
227 aa  108  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.396739  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3495  phosphoglycolate phosphatase  32.12 
 
 
238 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0294223  hitchhiker  0.0000911523 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0608  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  30.73 
 
 
217 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  2.17264e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2757  phosphoglycolate phosphatase  34.7 
 
 
243 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.411374  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2201  phosphoglycolate phosphatase  34.38 
 
 
226 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2701  phosphoglycolate phosphatase  31.36 
 
 
230 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364651  normal  0.0856305 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1237  HAD family hydrolase  34.26 
 
 
229 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1117  phosphoglycolate phosphatase  40.38 
 
 
209 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.31485  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2880  phosphoglycolate phosphatase  33.48 
 
 
246 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.587243  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0766  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  34.55 
 
 
222 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1144  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  35.86 
 
 
217 aa  105  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2697  phosphoglycolate phosphatase  32.64 
 
 
240 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3114  HAD family hydrolase  31.48 
 
 
216 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3031  2-phosphoglycolate phosphatase  35.53 
 
 
256 aa  105  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1245  phosphoglycolate phosphatase  39.9 
 
 
209 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2727  phosphoglycolate phosphatase  32.74 
 
 
227 aa  105  6e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1156  phosphoglycolate phosphatase  39.62 
 
 
209 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.53294 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2274  phosphoglycolate phosphatase  37.04 
 
 
216 aa  105  7e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0581  putative phosphoglycolate phosphatase protein  35.98 
 
 
233 aa  104  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  36.73 
 
 
219 aa  104  1e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03140  phosphoglycolate phosphatase  34.76 
 
 
216 aa  104  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2252  phosphoglycolate phosphatase  33.66 
 
 
233 aa  103  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.191906  normal  0.672709 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1177  phosphoglycolate phosphatase  39.42 
 
 
209 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2296  phosphoglycolate phosphatase  32.35 
 
 
233 aa  102  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal  0.0287022 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0925  phosphoglycolate phosphatase  33.68 
 
 
224 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0265  phosphoglycolate phosphatase  29.36 
 
 
227 aa  103  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0352  phosphoglycolate phosphatase  32.04 
 
 
241 aa  102  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1395  HAD family hydrolase  32.56 
 
 
215 aa  102  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>